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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005738`

染色体: Chr01 坐标: 73507227-73507982 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005738`
名称	SmilChr01G005738
描述	receptor-like protein 9DC3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73507227 - 73507982 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012939`
GeneID	`131012939`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012939`
原始查询	`SmilChr01G005738`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 9DC3
产物	receptor-like protein 9DC3
Arabidopsis	`AT2G33030` (RLP25) receptor like protein 25 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817865] identity=38.6; qcov=0.805; evalue=1.96e-42; confidence=medium
Rice	`Os01g0162800` - identity=49.4; qcov=0.701; evalue=1.2e-45; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13516 (LRR_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012939

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057796896.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796896.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796896.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796896.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796896.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73507665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B53
`Chr1:73507712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B53,B76
`Chr1:73507728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C56
`Chr1:73507729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C60
`Chr1:73507730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B53,B76
`Chr1:73507740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr1:73507788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:73507803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr1:73507816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:73507819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B58,C69,C79
`Chr1:73507826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr1:73507840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796896.1

251 aa

126

251

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF00560 LRR_1 47-67 aa PF13516 LRR_6 68-80 aa PF00560 LRR_1 69-90 aa PF00560 LRR_1 94-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796896.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	47	67	3.1e-16	56.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057796896.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	68	80	1.6e-05	25.3	Leucine Rich repeat
`XP_057796896.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	69	90	3.1e-16	56.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057796896.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	94	115	3.1e-16	56.7	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940913.1
ATGATGGATGTGAAGGAAAATAAGACAGATCTAATTAAAAGTAGTGATGATGATGATCTGATCTTTCAAGCTTTCCTGGAGATGACAGTCACCTTGAAAGGACAAGATCAGTTATTGACGAGACTGTTGAAAACCTTTACAACCATTGACTTATCCTCCAACAATTTCTCTGGTAGTATTCCAGATTCCATAGGTAATCTTAATTCTTTGAGATACTTGAATTTGTCGCACAATAATCTCATGGGACACATACCTGCATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012939
ATGATGGATGTGAAGGAAAATAAGACAGATCTAATTAAAAGTAGTGATGATGATGATCTGATCTTTCAAGCTTTCCTGGAGATGACAGTCACCTTGAAAGGACAAGATCAGTTATTGACGAGACTGTTGAAAACCTTTACAACCATTGACTTATCCTCCAACAATTTCTCTGGTAGTATTCCAGATTCCATAGGTAATCTTAATTCTTTGAGATACTTGAATTTGTCGCACAATAATCTCATGGGACACATACCTGCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796896.1
MMDVKENKTDLIKSSDDDDLIFQAFLEMTVTLKGQDQLLTRLLKTFTTIDLSSNNFSGSIPDSIGNLNSLRYLNLSHNNLMGHIPASLGNISVLESLDVSWNKLDGGIPSELTRLTFLAKLNLSKNDLVGQIPQSTQFSTFENDSYVGNMGLCGFPLTRKCNDENRHRMQPEEEDDEDDEYGFIDGFGWRSVVMGYGSGFIVGIGIGCWIIRFGRPRWLVEFFFGVGYTYNKKNKKKKKTRKRATPTHRRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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