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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005743`

染色体: Chr01 坐标: 73534364-73538552 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005743`
名称	SmilChr01G005743
描述	receptor-like protein 9DC3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73534364 - 73538552 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012953`
GeneID	`131012953`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012953`
原始查询	`SmilChr01G005743`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 9DC3
产物	receptor-like protein 9DC3
Arabidopsis	`AT2G33030` (RLP25) receptor like protein 25 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817865] identity=44; qcov=0.525; evalue=1.87e-35; confidence=medium
Rice	`Os01g0162800` - identity=48; qcov=0.584; evalue=6.39e-42; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF03834 (Rad10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012953

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057796921.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057796921.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057796921.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796921.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796921.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73534389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C17,C48,C66,C68
`Chr1:73534400`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C48
`Chr1:73534400`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C48
`Chr1:73534435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,B59,C74
`Chr1:73534469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B15,B41,C63,C80
`Chr1:73534495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr1:73534501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:73534526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B110
`Chr1:73534544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B124
`Chr1:73534555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C48
`Chr1:73534570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:73534610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B20,B40,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796921.1

303 aa

152

303

LRR_1

Rad10

PF00560 LRR_1 41-61 aa PF00560 LRR_1 63-84 aa PF00560 LRR_1 88-109 aa PF03834 Rad10 237-281 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796921.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	41	61	1.9e-15	54.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057796921.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	63	84	1.9e-15	54.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057796921.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	88	109	1.9e-15	54.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057796921.1`	Pfam	`PF03834`	Rad10	Domain	237	281	4.5e-14	53.0	Binding domain of DNA repair protein Ercc1 (rad10/Swi10)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940938.1
ATGATGGATGTAAAGGAAAATCAAACAGATGGATATTATGATGATTTTCAAAGATTTTTGGAGATGAGAATCACTTTGAAAGGTCTCGATCAGTTATTGAAGAGACTATTGGAAGCCTTTACAATCATTGACTTATCCTCCAACAATTTCTCTGGGAGTATTCCAGATTCCATAGGTAATCTGAATTCTTTGAGATACTTGAATTTGTCGCACAATAATCTCATGGGACACATACCTGCATCTCTTGGAAATATAAGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012953
ATGATGGATGTAAAGGAAAATCAAACAGATGGATATTATGATGATTTTCAAAGATTTTTGGAGATGAGAATCACTTTGAAAGGTCTCGATCAGTTATTGAAGAGACTATTGGAAGCCTTTACAATCATTGACTTATCCTCCAACAATTTCTCTGGGAGTATTCCAGATTCCATAGGTAATCTGAATTCTTTGAGATACTTGAATTTGTCGCACAATAATCTCATGGGACACATACCTGCATCTCTTGGAAATATAAGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796921.1
MMDVKENQTDGYYDDFQRFLEMRITLKGLDQLLKRLLEAFTIIDLSSNNFSGSIPDSIGNLNSLRYLNLSHNNLMGHIPASLGNISVLESLDLSWNKLDGRIPSELTRLTFLAKLNLSMNDLVGQIPQSTQFSTFENDSYVGNLRLCGFPLTRKCNEENGQRMQPEEQDDEEDDLPPPFRKLSILSKTLNFTPPPPSAPVAQSSKDAPSSSQGSHPRQTIQSEAPSTSVSSAGANRNAIIVSHRQKGNPLLKHIRNVRWV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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