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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005754`

染色体: Chr01 坐标: 73631093-73639404 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005754`
名称	SmilChr01G005754
描述	probable sulfate transporter 4.2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73631093 - 73639404 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005875`
GeneID	`131005875`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005875`
原始查询	`SmilChr01G005754`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable sulfate transporter 4.2
产物	probable sulfate transporter 4.2
Arabidopsis	`AT3G12520` (SULTR4;2) sulfate transporter 4;2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820431] identity=71.2; qcov=0.931; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0240500` (OsSultr4) - identity=72.3; qcov=0.928; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008271 (secondary active sulfate transmembrane transporter activity); GO:0008272 (GO:0008272); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00916 (Sulfate_transp); PF01740 (STAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005875

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057788963.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057788963.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057788963.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788963.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788963.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73631419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B37,C46,C57,C71
`Chr1:73631479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:73631854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr1:73632729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:73634875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B2
`Chr1:73635195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:73637009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:73637750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,C60,C7
`Chr1:73637782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr1:73638579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B78
`Chr1:73638653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:73638702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B117,B48,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788963.1

697 aa

348

697

Sulfate_transp

STAS

PF00916 Sulfate_transp 84-457 aa PF01740 STAS 508-627 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788963.1`	Pfam	`PF00916`	Sulfate_transp	Family	84	457	3e-127	425.2	Sulfate permease family
`XP_057788963.1`	Pfam	`PF01740`	STAS	Domain	508	627	4.5e-24	85.0	STAS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932980.1
GAATTTGAATGCGTGTTTCCTTAAAATATGGCTTTGAATTTTCGTATCCCCATTTTTTATTAGACTAAATAAATTTACTTATAAAAAATAATTCAACCGTTCAAGAAAATAAATTTGTACTAGCATATTGGCAAAAGAAAAGTGTTTTTTCATAACAAAAATTGTTTCCTTTTTGTATAAATCCATTTGGAAATTGTTTTCTACAGCTATTTATTTATTTATTGATTTATTTATTATACTATAAAAAAGTATAGTTTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005875
ATGGAGAGGGTGAGCCACTCCTCTCCCAGCGCCGGCGACCTCTCCTCCTTCGCCGCCACCGCCAGCCGCCCCGTGAAAATCATCCAATTGCAGCATCCCACCGCCGCCAGCTCCAGCTCCTCCGCCGCGCCGCCGTCGTCGTATTTCTGGAAATGGAGAGCGAGGATGAAGCGGATGACCTGGACGGACTGGATTGAGCTGTTCCTTCCCTGCTACCGTTGGATTAGCAGATACAAATGGCGCGAATATCTGCAGCCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788963.1
MERVSHSSPSAGDLSSFAATASRPVKIIQLQHPTAASSSSSAAPPSSYFWKWRARMKRMTWTDWIELFLPCYRWISRYKWREYLQPDLMAGITVGVMLVPQSMSYAKLAGLHPIYGLYSGFVPIFVYAVFGSSRQLAIGPVALTSLLVSNVLGKIVNPEDPLYTELAILLALMVGIFECIMGLLRLGWLLRFISHSVISGFTTASAIIIALSQAKDFLGYSVVRSSEIIPLVKSIIAGADQFLWQPFLMGSITLAVLLIM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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