当前解析结果
SmilChr01G005770| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005770 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005770 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G005770 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 73774872 - 73777998 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006073 |
|---|---|
| GeneID | 131006073 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006073 |
| 原始查询 | SmilChr01G005770 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006073 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057789197.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057789197.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057789197.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789197.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057789197.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:73776828 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B117,B122,B131,B85,C2 |
Chr1:73776857 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr1:73776862 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr1:73776880 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 17 | A19,A25,A4,B109,B112,B125,B49,B73,B83,B94,C10,C57,C75,C79,C82,D3,D9 |
Chr1:73776882 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B105,B73 |
Chr1:73777075 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C33,C51 |
Chr1:73777082 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C33 |
Chr1:73777118 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B130 |
Chr1:73777118 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B130 |
Chr1:73777333 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B20,C63 |
Chr1:73777368 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B137 |
Chr1:73777392 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A22,B38,B99 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。