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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005785`

染色体: Chr01 坐标: 73940626-73943502 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005785`
名称	SmilChr01G005785
描述	receptor-like protein 7
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73940626 - 73943502 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013002`
GeneID	`131013002`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013002`
原始查询	`SmilChr01G005785`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 7
产物	receptor-like protein 7
Arabidopsis	`AT1G47890` (RLP7) receptor like protein 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841206] identity=34.5; qcov=1.12; evalue=2.05e-132; confidence=low
Rice	`Os12g0215950` - identity=35.5; qcov=0.915; evalue=1.03e-117; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013002

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057796990.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796990.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796990.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796990.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796990.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73940841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A7,B12,B140,B30,B39,B7,B71,C24,C27,C38,C39,C44,C57,C69
`Chr1:73940879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B140
`Chr1:73940890`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A11,A8,B41,B59,B67,B9,C24,C33,C49,C64,C75
`Chr1:73940899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,C73
`Chr1:73940908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr1:73940944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C1,C27,C45,C47,C61
`Chr1:73940957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B72,C53
`Chr1:73940976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr1:73941115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B67
`Chr1:73941213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B96,C14,D5
`Chr1:73941275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:73941279`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B36,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796990.1

889 aa

444

889

LRRNT_2

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 27-68 aa PF00560 LRR_1 98-121 aa PF00560 LRR_1 255-276 aa PF13855 LRR_8 279-339 aa PF00560 LRR_1 304-325 aa PF00560 LRR_1 404-423 aa PF00560 LRR_1 474-493 aa PF00560 LRR_1 498-516 aa PF00560 LRR_1 519-538 aa PF13855 LRR_8 688-740 aa PF00560 LRR_1 706-727 aa PF00560 LRR_1 729-751 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796990.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	27	68	2.3e-07	31.7	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057796990.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	98	121	8.6e-42	132.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057796990.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	255	276	8.6e-42	132.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057796990.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	279	339	7.1e-42	141.7	Leucine rich repeat
`XP_057796990.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	304	325	8.6e-42	132.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057796990.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	404	423	8.6e-42	132.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057796990.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	474	493	8.6e-42	132.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057796990.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	498	516	8.6e-42	132.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057796990.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	519	538	8.6e-42	132.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057796990.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	688	740	7.1e-42	141.7	Leucine rich repeat
`XP_057796990.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	706	727	8.6e-42	132.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057796990.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	729	751	8.6e-42	132.8	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941007.1
ATGCTTCCAAAGTTGTTCTTCATCATTTCTACACTAATTTCCTCCTTCATCTTCACTCATTCTTACACCCAATGTCTTCACCATCAAAAAACCTTGTTGCTTCAACTCAAGGATGAGTTGAACTTTAATTCTTCTCTTTCAACAAAACTTGTGCAATGGAATCAAAGTGATGAGTGCTGCAAGTGGGACGGTGTGGCATGTGATGCTGCCGGCTACGTCGTTAGTTTGAAGCTCGATAACGAGTCCATTTCTGGTGAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013002
ATGCTTCCAAAGTTGTTCTTCATCATTTCTACACTAATTTCCTCCTTCATCTTCACTCATTCTTACACCCAATGTCTTCACCATCAAAAAACCTTGTTGCTTCAACTCAAGGATGAGTTGAACTTTAATTCTTCTCTTTCAACAAAACTTGTGCAATGGAATCAAAGTGATGAGTGCTGCAAGTGGGACGGTGTGGCATGTGATGCTGCCGGCTACGTCGTTAGTTTGAAGCTCGATAACGAGTCCATTTCTGGTGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796990.1
MLPKLFFIISTLISSFIFTHSYTQCLHHQKTLLLQLKDELNFNSSLSTKLVQWNQSDECCKWDGVACDAAGYVVSLKLDNESISGEIADSSSLFRLVHLQKLNLAYNYLINGPIPKGIDNLTYLTHLNLSYVGFGGQVPLQLSFLRRLVCLDISNWFFGSLSLEYPTLEMLVQNLAGLRELYLDGVNVTSSHESRKWSHIISSYLPNLTALSLVRCGLSGPFDNSFWQLHSLSILRLDLNHLGTELPDLFHNFPSLTTLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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