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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005810`

染色体: Chr01 坐标: 74123288-74123913 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005810`
名称	SmilChr01G005810
描述	mavicyanin-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74123288 - 74123913 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006117`
GeneID	`131006117`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006117`
原始查询	`SmilChr01G005810`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mavicyanin-like
产物	mavicyanin-like
Arabidopsis	`AT5G20230` (BCB) blue-copper-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832145] identity=37.2; qcov=0.777; evalue=6.97e-18; confidence=low
Rice	`Os03g0648500` (OsENODL11) - identity=50; qcov=0.86; evalue=3.91e-34; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009055 (electron transfer activity)
KEGG	-
Pfam	PF02298 (Cu_bind_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006117

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057789256.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057789256.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789256.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789256.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789256.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74123575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:74123600`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr1:74123600`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr1:74123614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:74123623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr1:74123625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B63
`Chr1:74123751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C48
`Chr1:74123773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B130,C19
`Chr1:74123779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr1:74123853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789256.1

121 aa

121

Cu_bind_like

PF02298 Cu_bind_like 28-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789256.1`	Pfam	`PF02298`	Cu_bind_like	Domain	28	112	1.9e-19	70.1	Plastocyanin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933273.1
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGCAATGGCTGCAACGATGATGTTAATTGCAGCACTACTCCTATGGAGTTCAGAGGCTTTGCAGCATAGAGTTGGAGATTCAATCTGGTCAATCCCTCCCACCATTAACTTCTACAAAAACTGGTCTTCTTCCTACACCTTCCACACCGGAGATTCTCTCTATTTCGACTTCGATTCGGGGCTCTACAACGTGCTTCAAGTGTCGAGGGGCGAGTTCGACCGGTGCACCGGAGACGAGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006117
ATGGCTGCAACGATGATGTTAATTGCAGCACTACTCCTATGGAGTTCAGAGGCTTTGCAGCATAGAGTTGGAGATTCAATCTGGTCAATCCCTCCCACCATTAACTTCTACAAAAACTGGTCTTCTTCCTACACCTTCCACACCGGAGATTCTCTCTATTTCGACTTCGATTCGGGGCTCTACAACGTGCTTCAAGTGTCGAGGGGCGAGTTCGACCGGTGCACCGGAGACGAGCCGTACAACGCCGCCTACGACGGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789256.1
MAATMMLIAALLLWSSEALQHRVGDSIWSIPPTINFYKNWSSSYTFHTGDSLYFDFDSGLYNVLQVSRGEFDRCTGDEPYNAAYDGPATIPLPLKGVSYYICNVSNYCALGQKVWIIVEQS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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