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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005818`

染色体: Chr01 坐标: 74169886-74181129 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005818`
名称	SmilChr01G005818
描述	uncharacterized SmilChr01G005818
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74169886 - 74181129 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013087`
GeneID	`131013087`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013087`
原始查询	`SmilChr01G005818`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0357300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=26.8; qcov=0.39; evalue=1.22e-41; confidence=low
Rice	`Os04g0357300` - identity=47.5; qcov=0.219; evalue=5.31e-112; confidence=weak
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0003678 (DNA helicase activity); GO:0006281 (DNA repair); GO:0043531 (ADP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF05970 (PIF1); PF13604 (AAA_30)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013087

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057797077.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057797077.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797077.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797077.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797077.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74170048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr1:74170880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B99,C74,C83
`Chr1:74170881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B11,C18
`Chr1:74170890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B117,B63,B64,C85
`Chr1:74170902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B55,C14
`Chr1:74170969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,C55,C78,D3
`Chr1:74171188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:74171216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:74171283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B129,C20
`Chr1:74171283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C20
`Chr1:74171287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr1:74171315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797077.1

1792 aa

896

1792

AAA_30

PIF1

NB-ARC

PF13604 AAA_30 402-606 aa PF05970 PIF1 402-609 aa PF00931 NB-ARC 955-1132 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797077.1`	Pfam	`PF13604`	AAA_30	Domain	402	606	9.4e-09	36.0	AAA domain
`XP_057797077.1`	Pfam	`PF05970`	PIF1	Family	402	609	8.5e-71	238.8	PIF1-like helicase
`XP_057797077.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	955	1132	1.5e-33	116.5	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941094.1
TCACCACATATCACACAACATGAGCACAAATCAAATTCTTTTTTTAATTAATATATTTATATTTATATATTGCAGTTAATGAGGTATATAGATCGACAAAGAAAAAATCTACAAAGACAAAAGAAACGTAAACGAAATGCAAGTGATTTGAATTGTTCATTGCTACATGAATTGAAAAATGTGCCTGATTGCATTCATTGTGGTGCAAGAAGATTTGAATATGAACCTCCTACTTTTTGTTGTGATAATGGAAAAGTTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013087
ATGAGGTATATAGATCGACAAAGAAAAAATCTACAAAGACAAAAGAAACGTAAACGAAATGCAAGTGATTTGAATTGTTCATTGCTACATGAATTGAAAAATGTGCCTGATTGCATTCATTGTGGTGCAAGAAGATTTGAATATGAACCTCCTACTTTTTGTTGTGATAATGGAAAAGTTAAACTTGTATTTTCTGAAGTTCCTCCGGAGTTGGATGAATTGTTTACAGCCCAGTCAGAAGAAGCTATTAATTTCAGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797077.1
MRYIDRQRKNLQRQKKRKRNASDLNCSLLHELKNVPDCIHCGARRFEYEPPTFCCDNGKVKLVFSEVPPELDELFTAQSEEAINFRRNIRAYNSIFSFTSFGVKLDKELASARRGVYSFRAQGMVYHDLPGLIPQYASPKIFQLYFYDTQSEFENIINIMQNQVLSEAVVQMLMKILEINPYAKFFRRLKDYPSMDNVQLHISKDVNLDQRVYNSPHADQVAAIWVEGNNENIPLERDIVVHAHSGDRHRIKHYYGCYDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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