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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005829`

染色体: Chr01 坐标: 74294086-74298103 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005829`
名称	SmilChr01G005829
描述	disease resistance protein RPP13-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74294086 - 74298103 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006135`
GeneID	`131006135`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006135`
原始查询	`SmilChr01G005829`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPP13-like
产物	disease resistance protein RPP13-like
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=29.6; qcov=0.655; evalue=4.83e-24; confidence=low
Rice	`Os11g0229400` - identity=27.4; qcov=0.608; evalue=3.51e-23; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0050832 (defense response to fungus)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006135

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789285.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789285.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789285.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789285.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789285.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74296610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B110,B44,B69,C13
`Chr1:74296610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B44,B69,C13
`Chr1:74296626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B10,B77,D6
`Chr1:74296782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B70,B76,C33,D4
`Chr1:74296986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:74296987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:74296990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:74297001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:74297123`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	B105,B113,B22,B34,B60,B66,B71,B8,C10,C12,C24,C31,C55,C72
`Chr1:74297126`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B105,B113,B22,B34,B60,B66,B71,B8,C10,C12,C24,C31,C55,C72
`Chr1:74297198`	`CG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A19,A3,B19,B39
`Chr1:74297204`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	B103,B105,B106,B129,B140,B27,B52,B78,C2,C42,C46,C67,C86,D2,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789285.1

403 aa

202

403

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 178-337 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789285.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	178	337	4.7e-30	105.1	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009095422.1
TGGAATTTCCCATTTCATCACCATATACAAAAATATCATAAACTAGTGCTTGTGAAATTAAGTAGCAAATTATCTAATTTCCACCAAACTCTGTAAATGGCAATGGCGGCAAGATTGAGTCAAATGATTTCTTGCAATTGAAAATCAAGACAAGAAGCTAAGATTCCATCTAAGAGAGGAGAAGAGAAGTTGTTCTGCTTTCATCTACTCTTCTTCTTGCTCACTCCAAATCCCACCTTAAATTCTTCATAGCAACCAGA...

XM_057933302.1
TGGAATTTCCCATTTCATCACCATATACAAAAATATCATAAACTAGTGCTTGTGAAATTAAGTAGCAAATTATCTAATTTCCACCAAACTCTGTAAATGGCAATGGCGGCAAGATTGAGTCAAATGATTTCTTGCAATTGAAAATCAAGACAAGAAGCTAAGATTCCATCTAAGAGAGGAGAAGAGAAGTTGTTCTGCTTTCATCTACTCTTCTTCTTGCTCACTCCAAATCCCACCTTAAATTCTTCATAGCAACCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006135
ATGACGGCTTATGGTGCAGTGAATTCTCTGAGGAATACAATTGATTATATTCTCCATTCTTCTCATTTTAGCCTCGTTGATCCCTCTCCAAATATCATACAAGTCGCCTACGAGGAGTTGAATCCATTGCAAGAAATTCTTGAAAGATTGGACAGCACGAGCAAGAGCAGGAGCAGGAGCAGGAAGAAGGTGAATGCTTTGGATGAAAGAATCAAAGAGTTGATTTGGGAATTCGAGGATATATTGGAATCACTTGTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789285.1
MTAYGAVNSLRNTIDYILHSSHFSLVDPSPNIIQVAYEELNPLQEILERLDSTSKSRSRSRKKVNALDERIKELIWEFEDILESLVYQHILSQFPADQVDEDDVGGEKIRFTIDLQFLQHHIPSFIERLEEMEEEYIYEVDNMPEDEDDDEVESISSRSGTKSKMIGLSDQFQHLKWSLTATSKQCFFAALVGTAGVGKTALAEAVFEDPEIISHFEHRIWVTVGRKSQFDDVSRDILAQMYGITQGDHELGAYLKERSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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