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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005830`

染色体: Chr01 坐标: 74302395-74306368 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005830`
名称	SmilChr01G005830
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74302395 - 74306368 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006126`
GeneID	`131006126`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006126`
原始查询	`SmilChr01G005830`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=23.8; qcov=0.947; evalue=9.16e-38; confidence=weak
Rice	`Os07g0186500` - identity=26.1; qcov=0.759; evalue=3.37e-39; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006126

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057789269.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057789269.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789269.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789269.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789269.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74302704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	44	A18,A19,A2,A25,A4,B111,B113,B125,B132,B137,B17,B18,B24,B25,B46,B48,B50,B6,B60,B61,B8,B84,B9,B91,B95,B98,C13,C16,C18,C2,C21,C22,C34,C37,C42,C44,C45,C48,C5,C50,C53,C59,C71,C75
`Chr1:74302716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B34,C67,D3
`Chr1:74303424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B88,C16,C78
`Chr1:74303466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:74303493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B107,B109
`Chr1:74303511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,D3
`Chr1:74303634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B71
`Chr1:74303668`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A7,B117,B123,B134,B14,B18,B73,B74,B77,B84,C20,C25,C41,C74
`Chr1:74303673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr1:74303720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr1:74303740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B22,B29,C38,C61
`Chr1:74303770`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A6,B105,B113,B129,B34,B53,B60,B62,B63,B70,B8,C31,C33,C42,C45,C67,C72,C74,C76,C9,D3,D4,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789269.1

922 aa

461

922

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 174-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789269.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	174	324	8.4e-24	84.8	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933286.1
CAATCACATGCAAAGGAAACAAGAAAATTAATAGCAAGTGGCCCAAATATTGAAATTTCCCATTTCATAACCATGCATCTACAAAAATCATAAAGTAGTAGGTGTGAAATTAATGGCACATTATCTGATTTCCACCAAACTCTGTAAATGGCAATGGCTGCAAGATTGAGTGGAGTCATTTCTTGCAATTGAAAATCAAGACAAGAAGCTAAGAGAGAAAAAGAGAAGTTGTTCTGCTTTGATTTTCAAGAATTTTATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006126
ATGACGGCATACGGTGCAGTGAATTCGCTGAGGAATACACTTGATTACATTCTCCATTCTTCTCATTCTAGCCTTGTGGGGTCCTCTCCATACATCTTACATTCTCCATTGCAAGATATTCTGGAAAAATTGGACAGCACAAGCACAAGCAAGAGCAGGAAGAAGGTGAATGCTTTGGATGGAAGAATCAAATACTTGATTTGGGAATTCGAGGACATATTGGAATCCCTTCTCTATCAACAGATTCTTTCACAAGTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789269.1
MTAYGAVNSLRNTLDYILHSSHSSLVGSSPYILHSPLQDILEKLDSTSTSKSRKKVNALDGRIKYLIWEFEDILESLLYQQILSQVEDEGIMKEGACGFQGLLESLPSQPQIVRNFNMARIMNESHVTSLMERLKEMEEEYVYEVDNMPEDDDEDESISTRSGNKPKMIGLSNTFQHLKEQVMKNEYEHYIFAVVGTAGIGKTALAETLFDDPDILGHFEHRAWVTVGRKSQSDDVLRSILTQMSGITQGKKCLVVLDDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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