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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005841`

染色体: Chr01 坐标: 74406422-74407996 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005841`
名称	SmilChr01G005841
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74406422 - 74407996 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013144`
GeneID	`131013144`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013144`
原始查询	`SmilChr01G005841`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance RPP8-like protein 3
产物	disease resistance RPP8-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=25.3; qcov=0.929; evalue=6.25e-17; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=26.4; qcov=0.853; evalue=2.66e-16; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013144

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797165.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057797165.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057797165.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797165.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797165.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74406439`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	B111,B130,B137,B17,B35,B4,B63,B70,B81,B84,B95,B97,B98,C11,C33,C54,C69,C75
`Chr1:74406485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr1:74406501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C35
`Chr1:74406551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B44,C39
`Chr1:74406560`	`AG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B45,B72,C47,C52
`Chr1:74406605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B5,C2,C48,C67
`Chr1:74406606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B120,B135
`Chr1:74406694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,D10
`Chr1:74406704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,B91
`Chr1:74406727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C32,C68
`Chr1:74406741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:74406743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B136,B140,B83,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797165.1

524 aa

262

524

LRR_14

PF23598 LRR_14 205-462 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797165.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	205	462	7.5e-11	42.1	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941182.1
ATGCGAAATTCAGTCTTCACTGATGCATATAATGAGATATCAAAGGTACTTTTCCCAAGTTACGACTACTTACCTCAATATCTTAAAATGCCTTTTCTGTATATGGGAGTCTTCCCTCCTGATTATGACATCCCTCTTTCCAAGATCATGAATATGTTGGCTACTGAGGATTGGTTTCATAACACAAAAAAGAAACGATCTTTGGAGGATTCTGTGTGGCAATGTTTGGACGAGCTTTGTAAGAATAAGAATCTTGTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013144
ATGCGAAATTCAGTCTTCACTGATGCATATAATGAGATATCAAAGGTACTTTTCCCAAGTTACGACTACTTACCTCAATATCTTAAAATGCCTTTTCTGTATATGGGAGTCTTCCCTCCTGATTATGACATCCCTCTTTCCAAGATCATGAATATGTTGGCTACTGAGGATTGGTTTCATAACACAAAAAAGAAACGATCTTTGGAGGATTCTGTGTGGCAATGTTTGGACGAGCTTTGTAAGAATAAGAATCTTGTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797165.1
MRNSVFTDAYNEISKVLFPSYDYLPQYLKMPFLYMGVFPPDYDIPLSKIMNMLATEDWFHNTKKKRSLEDSVWQCLDELCKNKNLVLFNQRSISRTTWMIVNHKFKTCRLHSSWRHVCRGEARKNKFYHVLKKLVEGLEDDVKGQRCLCLENNLLFGIKEFCNSVRLNCASSTRSLLFFGPYHQYPIPVGDDFKFLGKLDALNLRLYTFPIEILTLVLLKYLALTCNGELPATISKLFNLRVLIIHPHNSIRICGVPSYI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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