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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005845`

染色体: Chr01 坐标: 74426812-74427648 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005845`
名称	SmilChr01G005845
描述	transcription repressor OFP13-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74426812 - 74427648 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006146`
GeneID	`131006146`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006146`
原始查询	`SmilChr01G005845`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription repressor OFP13-like
产物	transcription repressor OFP13-like
Arabidopsis	`AT5G04820` (OFP13) ovate family protein 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830361] identity=44.8; qcov=0.902; evalue=3.92e-30; confidence=medium
Rice	`Os11g0156300` (OsOFP18) - identity=55.6; qcov=0.513; evalue=6.14e-27; confidence=medium
GO	GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF04844 (Ovate)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006146

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789299.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057789299.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057789299.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789299.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789299.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74427012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B129,B6,C63,C67
`Chr1:74427023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C68,C78
`Chr1:74427052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:74427091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C82,C9
`Chr1:74427294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr1:74427320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr1:74427337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C4,C85
`Chr1:74427354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr1:74427358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:74427405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:74427414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:74427420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789299.1

193 aa

193

Ovate

PF04844 Ovate 90-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789299.1`	Pfam	`PF04844`	Ovate	Family	90	146	1.3e-23	83.4	Transcriptional repressor, ovate

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933316.1
ATTCTCCAACACATATATATAATTCTCACAACACAACATATATACCAAAAAAATAAAAATGCCAAAGAAAATGAAAATCATCCCTTCATTCTTCAAGAATTACAAACAATGCCCCTCACCATGCACCCACCCCAAAACCCTCTCCTTCCGGGGGCACGACGCCCGCTGCGACGATGATCTCTCCCCGGCGACCGAAGACGAGGCGTCTCCGCAGCCGGCGAGGCTGTCGGAGCGGCTGTTCTTCGAGCCGGAGGAGACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006146
ATGCCAAAGAAAATGAAAATCATCCCTTCATTCTTCAAGAATTACAAACAATGCCCCTCACCATGCACCCACCCCAAAACCCTCTCCTTCCGGGGGCACGACGCCCGCTGCGACGATGATCTCTCCCCGGCGACCGAAGACGAGGCGTCTCCGCAGCCGGCGAGGCTGTCGGAGCGGCTGTTCTTCGAGCCGGAGGAGACGAGCTCGATCGTGCCGCGGCCTCCACGGCCGCGGCCGTTCAAGGGCAGCGTGGCGATGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789299.1
MPKKMKIIPSFFKNYKQCPSPCTHPKTLSFRGHDARCDDDLSPATEDEASPQPARLSERLFFEPEETSSIVPRPPRPRPFKGSVAMAVESEDPYVDFKRSMEEMVESQGLFKDWDCLEELLLWYLRMNGKMNHGFIVGAFVDLLVGFAAVESKKMTATAASAASDSTSATMYSSASSSFSSPYSSPLSHHDQL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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