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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005846`

染色体: Chr01 坐标: 74429897-74432449 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005846`
名称	SmilChr01G005846
描述	54S ribosomal protein L51, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74429897 - 74432449 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006148`
GeneID	`131006148`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006148`
原始查询	`SmilChr01G005846`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	54S ribosomal protein L51, mitochondrial
产物	54S ribosomal protein L51%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G59650` (AT3G59650) mitochondrial ribosomal protein L51/S25/CI-B8 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825134] identity=79.8; qcov=0.983; evalue=7.1e-69; confidence=high
Rice	`Os03g0207250` (OsRPL51) - identity=76.5; qcov=0.983; evalue=1.16e-65; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005762 (mitochondrial large ribosomal subunit); GO:0032543 (mitochondrial translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05047 (L51_S25_CI-B8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006148

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057789301.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057789301.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789301.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789301.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789301.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74430026`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C35
`Chr1:74431208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:74431244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr1:74431909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B109,B37,C3,C36
`Chr1:74431937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B1,B34,B45
`Chr1:74431962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B87,C32,C68,C78
`Chr1:74431969`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B125
`Chr1:74431969`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B125

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789301.1

121 aa

121

L51_S25_CI-B8

PF05047 L51_S25_CI-B8 26-77 aa

XP_057789302.1

121 aa

121

L51_S25_CI-B8

PF05047 L51_S25_CI-B8 26-77 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789301.1`	Pfam	`PF05047`	L51_S25_CI-B8	Domain	26	77	2.1e-14	54.0	Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain
`XP_057789302.1`	Pfam	`PF05047`	L51_S25_CI-B8	Domain	26	77	2.1e-14	54.0	Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933318.1
GTGTTCCCTAATTTCTTTTACGCTCTTCACTCACTTTGTTCGCTTTTTCTTCAAACTACACTCCCATTTTCGCGTTCTACTCCATAGCTGTAAACAGATCGATTCATCTTCAAAAGTCGAAATGTCTGTGAGAGGTGCGTGGCAGCTGAAGAAGCTTGTAGTGAGTTACTGCAATTGGGGTGGCAGTAGCAGAGGCATCAGGGCATTTATGGAGTCTCAGCTGCCAGATTTTATAGAGAAGAATCCTCAGCTTGAGGTGG...

XM_057933319.1
GCTTTTTCTTCAAACTACACTCCCATTTTCGCGTTCTACTCCATAGCTGTAAACAGATCGATTCATCTTCAAAAGTCGAAATGTCTGTGAGAGGTGCGTGGCAGCTGAAGAAGCTTGTAGTGAGTTACTGCAATTGGGGTGGCAGTAGCAGAGGCATCAGGGCATTTATGGAGTCTCAGCTGCCAGATTTTATAGAGAAGAATCCTCAGCTTGAGGTGGTCACTGAGCTAAATCGTGGTTATCATCCACTTTTGAAAGGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006148
ATGTCTGTGAGAGGTGCGTGGCAGCTGAAGAAGCTTGTAGTGAGTTACTGCAATTGGGGTGGCAGTAGCAGAGGCATCAGGGCATTTATGGAGTCTCAGCTGCCAGATTTTATAGAGAAGAATCCTCAGCTTGAGGTGGTCACTGAGCTAAATCGTGGTTATCATCCACTTTTGAAAGGATTCTATAAAAACAAAAATGAGCGCGTTGTCTGTGTGAAGAATATGACTCCGGAGGATGTACTCCAGTGTGCTACCAGGCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789301.1
MSVRGAWQLKKLVVSYCNWGGSSRGIRAFMESQLPDFIEKNPQLEVVTELNRGYHPLLKGFYKNKNERVVCVKNMTPEDVLQCATRLRNSQGRKVLKLKTRHVTKHPSVQGTWTTDLKITN

XP_057789302.1
MSVRGAWQLKKLVVSYCNWGGSSRGIRAFMESQLPDFIEKNPQLEVVTELNRGYHPLLKGFYKNKNERVVCVKNMTPEDVLQCATRLRNSQGRKVLKLKTRHVTKHPSVQGTWTTDLKITN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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