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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005847`

染色体: Chr01 坐标: 74432516-74435449 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005847`
名称	SmilChr01G005847
描述	GPI mannosyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74432516 - 74435449 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006147`
GeneID	`131006147`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006147`
原始查询	`SmilChr01G005847`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GPI mannosyltransferase 1-like
产物	GPI mannosyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT5G22130` (PNT1) mannosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832274] identity=69.2; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0670200` - identity=65.9; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004376 (GPI mannosyltransferase activity); GO:0006506 (GPI anchor biosynthetic process); GO:0016020 (membrane); GO:0051751 (alpha-1,4-mannosyltransferase activity); GO:1990529 (glycosylphosphatidylinositol-mannosyltransferase I complex)
KEGG	smil00563 (Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05007 (Mannosyl_trans); PF06728 (PIG-U)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006147

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057789300.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057789300.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789300.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789300.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789300.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74432669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:74432684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr1:74432700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:74432853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,D2
`Chr1:74432861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,C25,C35,D5,D8
`Chr1:74432892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr1:74432927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B5,B50
`Chr1:74432940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr1:74433202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B1,C41,D2
`Chr1:74433244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C5
`Chr1:74433264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,C60,C64,C66,D7
`Chr1:74433268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789300.1

434 aa

217

434

PIG-U

Mannosyl_trans

PF06728 PIG-U 41-380 aa PF05007 Mannosyl_trans 128-414 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789300.1`	Pfam	`PF06728`	PIG-U	Family	41	380	1.2e-14	55.0	GPI transamidase subunit PIG-U
`XP_057789300.1`	Pfam	`PF05007`	Mannosyl_trans	Family	128	414	2.9e-73	247.7	Mannosyltransferase (PIG-M)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933317.1
AGTGTGGTCTACTATTAAAACATTATTCACATTCAATTTGTTTAGTAAACCGCCGCTTACCCACACACCCCTCAGTCGCGTCCTCCGCCGCCGCGCCGCCGTTCAATCCATCACCGCCGATTCAATTGCTGTATGCATATAAGCTGAAATTTCGATTTTTCTCACATTCCGGATAGTATTTCCCAACATTTGAAACCGGGCTCAGTATCAAGGAAGGCGGCTGCGAATTGTCTTCGAGAATCGAGCAATGGCGGAGATAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006147
ATGGCGGAGATAGGTTTCCGATCCGTGCTTCTCATCTCAGCAGTGTTTCGCGTGGTTTTGATTCTGTACGGCGAGTGGCAAGATGCTCACATGGAGGTCAGATACACTGATATTGACTACTTCGTCTTCTCCGATGCCGCGGCATTAATGGCTTCTGGAAAATCGCCGTATGAAAGATCGACGTATCGGTATTCGCCGTTGATTGCTTTCCTTCTGATGCCTAATTCATTCCTGCATCGGTCGTGGGGAAAATTCATGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789300.1
MAEIGFRSVLLISAVFRVVLILYGEWQDAHMEVRYTDIDYFVFSDAAALMASGKSPYERSTYRYSPLIAFLLMPNSFLHRSWGKFMFSASDLLVGLLIHRILKLRGVPEKLSTYSAMVWLFNPFTFTIGTRGNCEPVVCSMILWILICLMKDHLLQAAFWYGLVVHLRIYPIIYALPIIILLDPCYFQPGKKPALVHWSFRTLKSSRDSSNAEITGFQYIWNFFRSMITWRRVMFGVLSGSTFLILTGFSFYLYGWDFLH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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