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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005868`

染色体: Chr01 坐标: 74618551-74620942 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005868`
名称	SmilChr01G005868
描述	receptor-like protein Cf-9 homolog
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74618551 - 74620942 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006166`
GeneID	`131006166`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006166`
原始查询	`SmilChr01G005868`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein Cf-9 homolog
产物	receptor-like protein Cf-9 homolog
Arabidopsis	`AT2G25440` (RLP20) receptor like protein 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817082] identity=37.9; qcov=0.982; evalue=6.04e-94; confidence=medium
Rice	`Os01g0161300` - identity=39.6; qcov=0.903; evalue=6.82e-91; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006166

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789325.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789325.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789325.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789325.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789325.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74618751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B140,B93,C27,C49
`Chr1:74618776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:74618778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C47,C73,C82
`Chr1:74618823`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B41,B56,B69,B96,C38,C42,C87,D7
`Chr1:74618840`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A10,B1,B138,B36,B58,B65,B74,B91,C24,C6,C69,C84
`Chr1:74618865`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B1,B113,B118,B34,B77,C1,C13,C30
`Chr1:74618878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,C17,C20,C36,C47
`Chr1:74618889`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A13,B131,B57,C1,C19,C45,C6,C75,C81,D9
`Chr1:74619001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr1:74619009`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A1,C54,C61,D8
`Chr1:74619009`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A1,C54,C61,D8
`Chr1:74619010`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A1,C54,C61,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789325.1

495 aa

248

495

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_14

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF00560 LRR_1 3-25 aa PF13855 LRR_8 3-63 aa PF00560 LRR_1 29-50 aa PF13855 LRR_8 29-87 aa PF23598 LRR_14 38-230 aa PF00560 LRR_1 53-74 aa PF00560 LRR_1 76-98 aa PF00560 LRR_1 100-122 aa PF13855 LRR_8 100-159 aa PF00560 LRR_1 124-144 aa PF00560 LRR_1 148-170 aa PF00560 LRR_1 223-240 aa PF00560 LRR_1 286-306 aa PF00560 LRR_1 309-330 aa PF00560 LRR_1 333-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789325.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	3	25	2.5e-42	134.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057789325.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	3	63	8.2e-33	112.7	Leucine rich repeat
`XP_057789325.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	29	50	2.5e-42	134.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057789325.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	29	87	8.2e-33	112.7	Leucine rich repeat
`XP_057789325.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	38	230	8.3e-25	88.0	Leucine-rich repeat region
`XP_057789325.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	53	74	2.5e-42	134.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057789325.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	76	98	2.5e-42	134.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057789325.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	100	122	2.5e-42	134.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057789325.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	100	159	8.2e-33	112.7	Leucine rich repeat
`XP_057789325.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	124	144	2.5e-42	134.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057789325.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	148	170	2.5e-42	134.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057789325.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	223	240	2.5e-42	134.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057789325.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	286	306	2.5e-42	134.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057789325.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	309	330	2.5e-42	134.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057789325.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	333	354	2.5e-42	134.4	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933342.1
ATTTGTAGGAGTTATTCCACAAGAGATTCATCATCTTGATAATTTACTAGAGTTGGACTTGAGTTCGAACAAGTTGTCTGGCACTTTGCCACCAACCATTTTCAACATGTCTTCCTTGGCATGGATTGACTTATCAAGTAACACACTTAGCGGGGCATTGCCTTCAGAAATTGGGAACATGAAAGCACTACTAGAGTATTTAAACCTTCAATACAATGCTTTAACCGGTACAATTCCGAGAGAAATGGGGAACATGGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006166
ATGTCTTCCTTGGCATGGATTGACTTATCAAGTAACACACTTAGCGGGGCATTGCCTTCAGAAATTGGGAACATGAAAGCACTACTAGAGTATTTAAACCTTCAATACAATGCTTTAACCGGTACAATTCCGAGAGAAATGGGGAACATGGAAGCACTACGGTTTTTATACCTTGAAAACAATAGTTTAACTGGTACTATTCCAAAAGAGATTGGAAATCTTCATAATTTGCAGTATATGTGGTTGGATTCCAACAAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789325.1
MSSLAWIDLSSNTLSGALPSEIGNMKALLEYLNLQYNALTGTIPREMGNMEALRFLYLENNSLTGTIPKEIGNLHNLQYMWLDSNKLIGELPSSICNLTSLHALILSNNTLEGTIPRCFGNLSSLTIFHLNENQFSGLIPSTFSEGCNLVSINLNGNKLQGPLPKSLINCRSLQGLDVGNNRIQNEFPFWMEVLPNLRVLVLRSNKFYGNMSLPSQTKIPFHNLQVLDISRNRLVGSLPQRYFKNFKAMKEENEKITSNE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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