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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005869`

染色体: Chr01 坐标: 74623630-74624504 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005869`
名称	SmilChr01G005869
描述	receptor-like protein 35
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74623630 - 74624504 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013161`
GeneID	`131013161`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013161`
原始查询	`SmilChr01G005869`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 35
产物	receptor-like protein 35
Arabidopsis	`AT3G11080` (RLP35) receptor like protein 35 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820279] identity=44.4; qcov=0.704; evalue=2.66e-20; confidence=low
Rice	`Os11g0172150` - identity=38; qcov=0.955; evalue=5.94e-25; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013161

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797187.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057797187.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797187.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797187.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797187.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74623659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr1:74623661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C46
`Chr1:74623694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:74624133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B70,B74
`Chr1:74624143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B70,B74
`Chr1:74624163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B134
`Chr1:74624174`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A4,B12,B66,C13
`Chr1:74624174`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A4,B12,B66,C13
`Chr1:74624308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C75
`Chr1:74624333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C75
`Chr1:74624356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr1:74624471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797187.1

179 aa

179

LRR_14

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF23598 LRR_14 11-125 aa PF00560 LRR_1 17-38 aa PF00560 LRR_1 66-88 aa PF13855 LRR_8 66-125 aa PF00560 LRR_1 90-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797187.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	11	125	1.9e-11	44.1	Leucine-rich repeat region
`XP_057797187.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	17	38	1.7e-13	48.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797187.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	66	88	1.7e-13	48.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797187.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	66	125	3.2e-09	37.1	Leucine rich repeat
`XP_057797187.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	90	112	1.7e-13	48.6	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941204.1
ATGGGTCTTGTCGGAACCCTCGCACCAGAAATCGGAAATCTTTCTTTCCTTGTCTCTTTAAATGCGAGCGAAAACTCTTTTCATGGCCCCATTCCCCCATCCATCTTCAACATGTCATTTCTAGAAGTTTTGGAAGTAAGGAATAATAGTTTGTCGAGTAGTTTACCTCTTGATATGTGCATACACAATCTGCATAGACTCAAGAGGCTTCGTTTGTCTTACAACGAGATGTATGGGGAAATACCATCGAGTTTGGAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013161
ATGGGTCTTGTCGGAACCCTCGCACCAGAAATCGGAAATCTTTCTTTCCTTGTCTCTTTAAATGCGAGCGAAAACTCTTTTCATGGCCCCATTCCCCCATCCATCTTCAACATGTCATTTCTAGAAGTTTTGGAAGTAAGGAATAATAGTTTGTCGAGTAGTTTACCTCTTGATATGTGCATACACAATCTGCATAGACTCAAGAGGCTTCGTTTGTCTTACAACGAGATGTATGGGGAAATACCATCGAGTTTGGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797187.1
MGLVGTLAPEIGNLSFLVSLNASENSFHGPIPPSIFNMSFLEVLEVRNNSLSSSLPLDMCIHNLHRLKRLRLSYNEMYGEIPSSLEKCSQLEYLSLVNNTFSGFVPREIGNLTKLQILYLGVNKLTDDAGMLGAAWLGYFWLATEAPRRGDDDRRRRKRRQSEEAVATATGIDRPETRE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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