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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005870`

染色体: Chr01 坐标: 74642540-74644411 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005870`
名称	SmilChr01G005870
描述	receptor-like protein 9DC3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74642540 - 74644411 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013167`
GeneID	`131013167`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013167`
原始查询	`SmilChr01G005870`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 9DC3
产物	receptor-like protein 9DC3
Arabidopsis	`AT2G33060` (RLP27) receptor like protein 27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817868] identity=39.7; qcov=0.928; evalue=2.07e-94; confidence=medium
Rice	`Os12g0222800` - identity=40.5; qcov=0.876; evalue=1.71e-89; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13855 (LRR_8); PF24141 (LRR_ComC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013167

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797201.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797201.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797201.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797201.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797201.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74642542`	`AAG`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B106,C85
`Chr1:74642565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr1:74642568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B16,B5,C50
`Chr1:74642571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr1:74642620`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A5,B138,B59,C11,C24,C84
`Chr1:74642648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B22,C56,C66
`Chr1:74642693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C44
`Chr1:74642740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B43
`Chr1:74642764`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	60	A10,A21,A24,A4,A5,A6,A8,B1,B104,B11,B110,B111,B117,B12,B124,B132,B135,B17,B20,B21,B22,B34,B35,B36,B42,B43,B46,B55,B59,B63,B77,B79,B80,B87,B9,B93,B95,B97,C1,C18,C23,C30,C33,C40,C43,C45,C46,C56,C59,C6,C60,C62,C66,C71,C74,C82,D4,D5,D7,D9
`Chr1:74642779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B23,C50,C60
`Chr1:74642781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C7
`Chr1:74642791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A15,B104,B106,B126,B138,B29,B34,B35,B51,B52,B66,B92,C14,C27,C51,C59,C75,C77,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797201.1

499 aa

250

499

LRR_ComC

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF24141 LRR_ComC 20-117 aa PF00560 LRR_1 34-56 aa PF13855 LRR_8 34-93 aa PF00560 LRR_1 58-80 aa PF13855 LRR_8 58-117 aa PF00560 LRR_1 83-104 aa PF00560 LRR_1 106-128 aa PF00560 LRR_1 156-177 aa PF00560 LRR_1 230-247 aa PF00560 LRR_1 296-316 aa PF13855 LRR_8 296-353 aa PF00560 LRR_1 319-340 aa PF00560 LRR_1 343-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797201.1`	Pfam	`PF24141`	LRR_ComC	Repeat	20	117	5e-11	43.5	EGF-like domain-containing protein ComC LRR domain
`XP_057797201.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	34	56	1.2e-36	117.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057797201.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	34	93	7.8e-34	116.0	Leucine rich repeat
`XP_057797201.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	58	80	1.2e-36	117.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057797201.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	58	117	7.8e-34	116.0	Leucine rich repeat
`XP_057797201.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	83	104	1.2e-36	117.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057797201.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	106	128	1.2e-36	117.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057797201.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	156	177	1.2e-36	117.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057797201.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	230	247	1.2e-36	117.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057797201.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	296	316	1.2e-36	117.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057797201.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	296	353	7.8e-34	116.0	Leucine rich repeat
`XP_057797201.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	319	340	1.2e-36	117.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057797201.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	343	364	1.2e-36	117.5	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941218.1
ATGGAAGCACTAAATCTTTTATTCCTTGGAAACAATGACTTTGACTTTAGGACGCAAACATTAAAAGGAGTTATTCCACAAGAGATACATCGTCTTCATAATTTAAGAGCGTTGTACTTGAGTTTTAACAAGTTGTCAGGCACTTTGCCACCAACTATTTTCAACCTGTCTTCCTTGACATGGATTGAGTTATCAAGTAACAAACTTAGCGGAGCATTGCCTTCAGAAATTGGGAACATGAAAGCACTATCTACTTTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013167
ATGGAAGCACTAAATCTTTTATTCCTTGGAAACAATGACTTTGACTTTAGGACGCAAACATTAAAAGGAGTTATTCCACAAGAGATACATCGTCTTCATAATTTAAGAGCGTTGTACTTGAGTTTTAACAAGTTGTCAGGCACTTTGCCACCAACTATTTTCAACCTGTCTTCCTTGACATGGATTGAGTTATCAAGTAACAAACTTAGCGGAGCATTGCCTTCAGAAATTGGGAACATGAAAGCACTATCTACTTTACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797201.1
MEALNLLFLGNNDFDFRTQTLKGVIPQEIHRLHNLRALYLSFNKLSGTLPPTIFNLSSLTWIELSSNKLSGALPSEIGNMKALSTLQLQNNALIGTIPSSICNLTSLEALLLSNNNLEGTIPQCFGNLSKSLFIFHLNVNQFSGLIPSSFSKGCGLVSINLNGNKLQGPLPKSLINCQRLRDLDVGNNRIQDEFPFWMEVLPDLQVLVLRANKFYGNMSLPSQTKIPFHNLQVLDISQNRFVGSLPQGYFKNFRAMIEVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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