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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005879`

染色体: Chr01 坐标: 74736043-74737665 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005879`
名称	SmilChr01G005879
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74736043 - 74737665 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006173`
GeneID	`131006173`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006173`
原始查询	`SmilChr01G005879`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
产物	UPF0481 protein At3g47200-like
Arabidopsis	`AT5G11290` (AT5G11290) transmembrane protein, putative (DUF247) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831000] identity=33.6; qcov=1.03; evalue=1.35e-62; confidence=low
Rice	`Os01g0562600` - identity=31.7; qcov=0.952; evalue=1.21e-45; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006173

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789332.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057789332.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057789332.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789332.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789332.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74736193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C3
`Chr1:74736202`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B108
`Chr1:74736202`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B108
`Chr1:74736253`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B56,B96,D3
`Chr1:74736253`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B56,B96,D3
`Chr1:74736260`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B111,B51,C7
`Chr1:74736260`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B111,B51,C7
`Chr1:74736275`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A19,B108
`Chr1:74736275`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A19,B108
`Chr1:74736311`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B112,B22,B76,B89,C39,C56,C64,C66,C79
`Chr1:74736317`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	40	A14,A9,B100,B104,B107,B108,B11,B112,B126,B127,B136,B138,B19,B27,B32,B45,B57,B60,B61,B66,B67,B70,B73,B78,B79,B8,B88,C12,C16,C29,C37,C38,C4,C46,C54,C58,C73,C8,C85,C9
`Chr1:74736320`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B122,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789332.1

418 aa

209

418

DUF247

PF03140 DUF247 30-407 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789332.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	30	407	4.9e-104	349.6	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933349.1
CGAACACTCATTTTGTCAATACAATAATGAAAAAAGTTCTTTAAAAAGAAAATAACACGAAGAAATCAGCTGCAATGTACAACTTTTTTCGTGTTTCAGCCACTCAAATTCCCTGGTGATAATCTACATATATATTTTCTGGTTTCTTGGCTTAATTCTTGAAGATGACAGAGGAGAGAGACTGTGTTGTTGTTAGGATTGAAAACTTGCTTCATCATTTGTCTACTTCTCTCACTCCCTCAAAGCCTATCATAGCTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006173
ATGACAGAGGAGAGAGACTGTGTTGTTGTTAGGATTGAAAACTTGCTTCATCATTTGTCTACTTCTCTCACTCCCTCAAAGCCTATCATAGCTAAAGTAGATCAACACCTGAGGCAAGTAAATGAAAAGGATTTTGAACCCGAATTAGTCTCTATAGGCCCAATCCATCGTGGGAAAGATCGCGTTAAGGCCATGGAGCAGCACAAGCTGAGGTATCTAAGAAAAACATTAGGAAGAAGGGATGAGTTGAGTGTTGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789332.1
MTEERDCVVVRIENLLHHLSTSLTPSKPIIAKVDQHLRQVNEKDFEPELVSIGPIHRGKDRVKAMEQHKLRYLRKTLGRRDELSVEKCVLEVRRMEEKARLYYAKSISLDQDEFVEMLLLDGCFVIELLRSYWFNDLRDKNDQIFQFDHMLVQIRHDLLLLENQLPFFVLNELFDVTRMEHPDDNIHHLLLFLAGDVLPWPDSSKLDYSSEMLHNAEHILGLVYDSFFSFSFSAKCFTENNGCNTVHHTCSASEMEEAGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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