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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005884`

染色体: Chr01 坐标: 74758092-74760846 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005884`
名称	SmilChr01G005884
描述	receptor like protein 23-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74758092 - 74760846 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006178`
GeneID	`131006178`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006178`
原始查询	`SmilChr01G005884`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor like protein 23-like
产物	receptor like protein 23-like
Arabidopsis	`AT2G33060` (RLP27) receptor like protein 27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817868] identity=37.5; qcov=0.929; evalue=3.14e-119; confidence=medium
Rice	`Os01g0132100` - identity=37.9; qcov=0.865; evalue=5.88e-114; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006178

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789339.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789339.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789339.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789339.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789339.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74758390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:74758405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:74758414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:74758475`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B9,C26
`Chr1:74758475`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B9,C26
`Chr1:74758565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr1:74758572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr1:74758589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B9,C26
`Chr1:74758607`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B107,B126,B133,B37,B44,B82,C19,C29,C69
`Chr1:74758609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B9,C26
`Chr1:74758612`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B107,B126,B133,B37,B44,B82,C19,C29,C69
`Chr1:74758618`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A22,A4,B107,B126,B133,B37,B44,B53,B82,C28,C58,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789339.1

817 aa

408

817

LRRNT_2

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 35-77 aa PF00560 LRR_1 108-129 aa PF00560 LRR_1 131-153 aa PF00560 LRR_1 156-177 aa PF13855 LRR_8 179-240 aa PF00560 LRR_1 206-226 aa PF00560 LRR_1 311-329 aa PF00560 LRR_1 406-426 aa PF00560 LRR_1 429-448 aa PF13855 LRR_8 429-489 aa PF00560 LRR_1 454-474 aa PF00560 LRR_1 478-500 aa PF13855 LRR_8 621-678 aa PF00560 LRR_1 643-665 aa PF00560 LRR_1 668-689 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789339.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	35	77	3.1e-08	34.5	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057789339.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	108	129	1.7e-40	128.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789339.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	131	153	1.7e-40	128.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789339.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	156	177	1.7e-40	128.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789339.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	179	240	2.5e-30	104.7	Leucine rich repeat
`XP_057789339.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	206	226	1.7e-40	128.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789339.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	311	329	1.7e-40	128.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789339.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	406	426	1.7e-40	128.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789339.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	429	448	1.7e-40	128.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789339.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	429	489	2.5e-30	104.7	Leucine rich repeat
`XP_057789339.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	454	474	1.7e-40	128.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789339.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	478	500	1.7e-40	128.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789339.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	621	678	2.5e-30	104.7	Leucine rich repeat
`XP_057789339.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	643	665	1.7e-40	128.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789339.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	668	689	1.7e-40	128.9	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933356.1
CTTAACCTCAGGTTTCTACACAGCACAACACTATCCCTCTTCAATGGCTATCTCTTTGCTTTTACAATTTCTTTTCATCATTCTACTTCCACAATCAATTGCCAAAACACATGTTACTGATCATGCTCAAACACACTGCATAGAGCATGAGAAAAATTTGTTGCTTGAGTTGAAGAACCAACTGGTATTCAATTCATCTTATTCAACAAATCTGGTGCAATGGAACGTCGACGAAACGGGCGATTGTTGCAGCTGGCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006178
ATGGCTATCTCTTTGCTTTTACAATTTCTTTTCATCATTCTACTTCCACAATCAATTGCCAAAACACATGTTACTGATCATGCTCAAACACACTGCATAGAGCATGAGAAAAATTTGTTGCTTGAGTTGAAGAACCAACTGGTATTCAATTCATCTTATTCAACAAATCTGGTGCAATGGAACGTCGACGAAACGGGCGATTGTTGCAGCTGGCAAGGTGTGGGTTGCGACGACGCCGGCCATGTTATCAGTTTGTGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789339.1
MAISLLLQFLFIILLPQSIAKTHVTDHAQTHCIEHEKNLLLELKNQLVFNSSYSTNLVQWNVDETGDCCSWQGVGCDDAGHVISLWLKDEAISGGFNESSSLFNLKFLKKLSLSNNLFSSSLPHSITNLESLSHLYLSNATFSGTIPLALGNLTRLVHVDLSGNFFSGAIPLALGNLTRLVHVDLSHNFFSGSISSIHFEGLYKIDTIDLSYNSLSGSIPKSISTLFSSLWQLDLHNNQFHGQLSEFLDEDISKLHSFHD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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