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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005889`

染色体: Chr01 坐标: 74811662-74814578 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005889`
名称	SmilChr01G005889
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74811662 - 74814578 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006182`
GeneID	`131006182`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006182`
原始查询	`SmilChr01G005889`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
Arabidopsis	`AT3G47570` (AT3G47570) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823911] identity=37; qcov=1.09; evalue=1.45e-104; confidence=medium
Rice	`Os01g0694000` - identity=40.3; qcov=1.02; evalue=9.48e-127; confidence=medium
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006182

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789346.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789346.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789346.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789346.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789346.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74813039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C60
`Chr1:74813047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	40	A10,A14,A16,A20,A22,A23,B10,B102,B12,B121,B133,B14,B17,B2,B29,B59,B6,B62,B7,C10,C20,C28,C30,C41,C45,C46,C53,C56,C63,C64,C66,C70,C72,C73,C75,C76,C77,C84,C9,D11
`Chr1:74813119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C29
`Chr1:74813155`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B49,B72,B9,C1,C13,C31,C73,C82
`Chr1:74813158`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B49,B72,B9,C1,C13,C31,C73,C82
`Chr1:74813161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B65,C42
`Chr1:74813164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr1:74813165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,C33,C46,D4
`Chr1:74813180`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A16,B10,B102,B115,B127,B139,B14,B17,B29,B31,B58,B81,C18,C20,C28,C46,C66,C70,C72,C73,C75,C76,C84,C9
`Chr1:74813191`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A22,A4,B12,B6,B63,B64,C16,C29,C3,C63
`Chr1:74813222`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C23,C8
`Chr1:74813230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,C1,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789346.1

478 aa

239

478

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00560 LRR_1 30-52 aa PF00560 LRR_1 54-76 aa PF00069 Pkinase 198-466 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 200-469 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789346.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	30	52	3.3e-10	38.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057789346.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	54	76	3.3e-10	38.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057789346.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	198	466	5.8e-38	131.5	Protein kinase domain
`XP_057789346.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	200	469	1.9e-38	133.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933363.1
AAATTCATTAAATGGGTCACTACCTCTAGAGATGAGTAACTTAGGAGCAGCTATCTATATAAATGTAGCAATGAATCAGTTGTCAGGGTCAATTCCGAGGAATATCGAAAAGTTGCAGAATTTGGTTGATCTGTCTTTGGCAAATAATAGACTAGAAGGTTCTATTCCCGTGTCTATGGGAAGCATGATCAGTTTGGCAAATCTCGACTTGTCGTACAACAACCTCTCTGGTTCAATTCCAAAGTCTTTAGAAACACTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006182
ATGAGTAACTTAGGAGCAGCTATCTATATAAATGTAGCAATGAATCAGTTGTCAGGGTCAATTCCGAGGAATATCGAAAAGTTGCAGAATTTGGTTGATCTGTCTTTGGCAAATAATAGACTAGAAGGTTCTATTCCCGTGTCTATGGGAAGCATGATCAGTTTGGCAAATCTCGACTTGTCGTACAACAACCTCTCTGGTTCAATTCCAAAGTCTTTAGAAACACTTCAACACCTCGACTACTTTAATGTCTCTTTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789346.1
MSNLGAAIYINVAMNQLSGSIPRNIEKLQNLVDLSLANNRLEGSIPVSMGSMISLANLDLSYNNLSGSIPKSLETLQHLDYFNVSFNSLSGEIPNGGSFRNFTMDSFKGNEALCGIPKFHVQICSSISNHRSKRKKVERASFIVFGVVAFISIVSLAFVIVRNKRKDKTAREVDELIFIVPERISYYELLQATERFDESNLLGTGSSCSVYKGILNNGKDIVVKVFNMQLEGISRIFDVKCEILRSIRHRNLTSVISSCS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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