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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005900`

染色体: Chr01 坐标: 74901583-74903518 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005900`
名称	SmilChr01G005900
描述	phosphoglycerate mutase-like protein AT74H
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74901583 - 74903518 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006191`
GeneID	`131006191`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006191`
原始查询	`SmilChr01G005900`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoglycerate mutase-like protein AT74H
产物	phosphoglycerate mutase-like protein AT74H
Arabidopsis	`AT3G05170` (AT3G05170) Phosphoglycerate mutase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819681] identity=56.1; qcov=0.85; evalue=1.77e-93; confidence=high
Rice	`Os05g0141700` - identity=55.2; qcov=0.864; evalue=4.46e-89; confidence=high
GO	GO:0016791 (phosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00300 (His_Phos_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006191

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789355.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789355.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057789355.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789355.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789355.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74901728`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	41	A14,A18,A7,B106,B109,B119,B124,B127,B129,B19,B21,B23,B31,B38,B39,B40,B41,B53,B56,B6,B60,B61,B67,B70,B76,B91,B96,C13,C15,C19,C35,C44,C60,C62,C63,C67,C76,C9,D2,D3,D8
`Chr1:74901785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr1:74901789`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B138,B41,C67,D2
`Chr1:74901789`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B138,B41,C67,D2
`Chr1:74901834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr1:74901843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:74901846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B64,C11,C69
`Chr1:74901861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B112,B129,B27,B7
`Chr1:74903081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr1:74903164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B29,B31,B48
`Chr1:74903190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:74903242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789355.1

287 aa

144

287

His_Phos_1

PF00300 His_Phos_1 24-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789355.1`	Pfam	`PF00300`	His_Phos_1	Domain	24	228	8.4e-27	94.8	Histidine phosphatase superfamily (branch 1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933372.1
ACCTGATCATTCACCAAAACCCTACACACAAAAAATGTCTACTACCGGAAACCTCAACACCTTCTCCGACCACCACCACCGCCACCGCCACCTCCCGCGGCGCATCATTCTGGTGCGCCACGGCGAGAGCGAGGTGAACGAGGACGAGGCGGTCCTCGAGTACGTCCCCAACTACAAGATCAAGCTGATCAAGAAGGGCATCGGCCAAGCCCAGGCGGCGGGCCGGGAAATCAAGGAGATCGTCTCGGACAACGAGGGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006191
ATGTCTACTACCGGAAACCTCAACACCTTCTCCGACCACCACCACCGCCACCGCCACCTCCCGCGGCGCATCATTCTGGTGCGCCACGGCGAGAGCGAGGTGAACGAGGACGAGGCGGTCCTCGAGTACGTCCCCAACTACAAGATCAAGCTGATCAAGAAGGGCATCGGCCAAGCCCAGGCGGCGGGCCGGGAAATCAAGGAGATCGTCTCGGACAACGAGGGGTGGAAGGCGCTGTTCTACGTCTCGCCGTCGAGTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789355.1
MSTTGNLNTFSDHHHRHRHLPRRIILVRHGESEVNEDEAVLEYVPNYKIKLIKKGIGQAQAAGREIKEIVSDNEGWKALFYVSPSSRTRETMEEIICRGGTFEKDRIVGVREECRLREQHFGNFQDVEERRKIKRSRNRYGKFFYRVPNGESSADVYDRVSTFLEGLWRDMESNKFSNEMNLIVVSHGLTILLFLMKWFNWTVDQFEGLTNPTNCEYRVLELGPDGEYSLALHHQLDQLKKWGLSNEMIEDQIIRARGLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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