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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005921`

染色体: Chr01 坐标: 75032688-75035345 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005921`
名称	SmilChr01G005921
描述	uncharacterized SmilChr01G005921
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75032688 - 75035345 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013372`
GeneID	`131013372`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013372`
原始查询	`SmilChr01G005921`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821664]; symbol=AT3G21120; hit=AT3G21120; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821664]; symbol=AT3G21120; hit=AT3G21120; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G21120` (AT3G21120) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821664] identity=28.5; qcov=0.273; evalue=6.2e-06; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3); PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013372

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057797424.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057797424.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057797424.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797424.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797424.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75032737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B78,D11
`Chr1:75032744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B34
`Chr1:75032781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B20,B27,C18
`Chr1:75032999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr1:75033076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr1:75033554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr1:75034179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr1:75034553`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A15,A20,A23,B1,B111,B125,B126,B127,B18,B20,B6,B83,B99,C21,C27,C30,C35,C48,C51,C63,C67,C73,C85,C9
`Chr1:75034683`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B111,B127,C27,C51,C63
`Chr1:75034683`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B111,B127,C27,C51,C63
`Chr1:75034706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:75034740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797424.1

604 aa

302

604

FBA_3

FBA_1

Retrotran_gag_2

zf-CCHC

PF08268 FBA_3 22-244 aa PF07734 FBA_1 51-220 aa PF14223 Retrotran_gag_2 364-537 aa PF00098 zf-CCHC 563-578 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797424.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	22	244	3e-08	33.8	F-box associated beta propeller domain
`XP_057797424.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	51	220	1e-18	68.1	F-box associated beta propeller domain
`XP_057797424.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	364	537	2.4e-32	112.7	gag-polypeptide of LTR copia-type
`XP_057797424.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	563	578	3.3e-05	24.5	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941441.1
TCATAATTCCAAAAACCTAGTTAATTAACCTAAAACCGCAATTTACCACGATCCAAACAAACCCTCATCCCCTCTCTCTCTATTCTCTCCCTCTCTAGAATTGGCGACGCGCAGGGATTCGCCGATTTGGGTTGCTTTGAAGAGTTTTCAAGTTTTGATTCTATAGTATAAGAAAGAATGGATGAGCATATTTTGAAAAGTTTTAATGGTGGTGGCGATAAAAAGCATTATTTATCTACTATGTCTGCCCAAGACATGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013372
ATGGATGAGCATATTTTGAAAAGTTTTAATGGTGGTGGCGATAAAAAGCATTATTTATCTACTATGTCTGCCCAAGACATGTCTCCCAAGGAAGGCTTCGAAACTACCAATCTTTTCTCTTATGATTATAGAACACAACATGTTGGTGGTAATACTTGTCGCGGGTTGTTGTATTTCAATTTTGATGACCAAATTGTTCTTTGCAACTTAAGAACTAAAGAGCTGAAATTTGTTGCTCCGCCCAAGAAACCCATTCCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797424.1
MDEHILKSFNGGGDKKHYLSTMSAQDMSPKEGFETTNLFSYDYRTQHVGGNTCRGLLYFNFDDQIVLCNLRTKELKFVAPPKKPIPSHTWFNGCGLGYDSKSGDYKLIRNYYRWSCCNGGDDEDEDSEYFYQHRCGPHEEKTELYSLKSDSWKEIPTPDAYIDLIHMCGVYVEGSCYWPARQGSAFGGRRSREDVCDILSFDFTDESFSWIPSPISDYRFEYDLVECRGFLGAIAYENTYGSPKCGVNSFELSVWKERSW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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