当前解析结果
SmilChr01G005925| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005925 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005925 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G005925 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 75057005 - 75058485 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131013390 |
|---|---|
| GeneID | 131013390 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131013390 |
| 原始查询 | SmilChr01G005925 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131013390 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057797443.1 |
| 2 | Telomere | 端粒 | 0.40000 | XP_057797443.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057797443.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057797443.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057797443.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:75057059 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,B80,B89 |
Chr1:75057087 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A21,B80 |
Chr1:75057172 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
Chr1:75057287 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B51,C6,C69 |
Chr1:75057294 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B105,C30 |
Chr1:75057294 |
C |
CT |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B105,C30 |
Chr1:75057306 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C5,C62 |
Chr1:75057325 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C5,C62 |
Chr1:75057453 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C3 |
Chr1:75057455 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C3 |
Chr1:75057696 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D3 |
Chr1:75057754 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A5,C79 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。