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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005929`

染色体: Chr01 坐标: 75079557-75080189 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005929`
名称	SmilChr01G005929
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75079557 - 75080189 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013416`
GeneID	`131013416`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013416`
原始查询	`SmilChr01G005929`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
Arabidopsis	`AT3G06240` (AT3G06240) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819798] identity=26.6; qcov=1.09; evalue=1.45e-07; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013416

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057797473.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057797473.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057797473.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057797473.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797473.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75079581`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A22
`Chr1:75079581`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A22
`Chr1:75079590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B59,C75,D11
`Chr1:75079676`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C21,C30
`Chr1:75079676`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C21,C30
`Chr1:75079773`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A20,B103,B12,B129,B23,B40,B50,B70,B81,B83,B92,C15,C19,C23,C35,C62,C75,D3
`Chr1:75079776`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A14,B106,B119,B31,B59,B67,B7,B71,B75,B85,B91,C13,C31,C44
`Chr1:75079844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr1:75079845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,A22,B9,C82
`Chr1:75079936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B136,B40
`Chr1:75079939`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	A20,A25,A3,B123,B124,B133,B136,B138,B14,B2,B44,B45,B58,B60,B62,B65,B75,B84,B86,B9,B98,C1,C10,C24,C28,C38,C46,C5,C53,C58,C6,C72,C77,C9,D4
`Chr1:75079948`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B21,C34,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797473.1

210 aa

105

210

FBA_1

PF07734 FBA_1 4-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797473.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	4	182	2.5e-11	43.9	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941490.1
ATGTCATGCTTTTATTTCTACTGTTGTGGGTTCGGTTGGGATGAATCGAGCGACGATTACAAGGTTTTTGCGATTGCGGCTAGAGCTAGCGGCAAATCTATATATTGGATATATAGCTTGAAGAGTGATTCTTGGAAGGAATCAGAGGAAGTGAAGGGTTGGGATTCATGTAAGAAGGCTGATCGTCCTCAAAATAAAGGAAGTGAAATGGGGATGTTTGCAAGTGGGAGTCTTCATTGGGAGACGACTGATAGACGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013416
ATGTCATGCTTTTATTTCTACTGTTGTGGGTTCGGTTGGGATGAATCGAGCGACGATTACAAGGTTTTTGCGATTGCGGCTAGAGCTAGCGGCAAATCTATATATTGGATATATAGCTTGAAGAGTGATTCTTGGAAGGAATCAGAGGAAGTGAAGGGTTGGGATTCATGTAAGAAGGCTGATCGTCCTCAAAATAAAGGAAGTGAAATGGGGATGTTTGCAAGTGGGAGTCTTCATTGGGAGACGACTGATAGACGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797473.1
MSCFYFYCCGFGWDESSDDYKVFAIAARASGKSIYWIYSLKSDSWKESEEVKGWDSCKKADRPQNKGSEMGMFASGSLHWETTDRRGMVACDLKTEVLGAVELPECRGSCRWEGIGVIGECLSVYYWCKDSSSLDIWMKKKESWEKAMVLDQFCSPLHISPVLAHFWSGGGFLLIKMENLLVFDRKGFRDLVSLRSSHVHIESLVSPLEF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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