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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005938`

染色体: Chr01 坐标: 75118189-75119802 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005938`
名称	SmilChr01G005938
描述	uncharacterized SmilChr01G005938
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75118189 - 75119802 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006214`
GeneID	`131006214`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006214`
原始查询	`SmilChr01G005938`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsFbox489; symbol=OsFbox489; hit=Os09g0448100; species=rice; confidence=weak
产物	OsFbox489; symbol=OsFbox489; hit=Os09g0448100; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os09g0448100` (OsFbox489) - identity=21.7; qcov=0.676; evalue=6.18e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006214

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789378.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057789378.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057789378.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789378.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789378.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75118461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:75118519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:75118615`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C74
`Chr1:75118615`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C74
`Chr1:75118656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr1:75118849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C74
`Chr1:75118851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr1:75118878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr1:75118897`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	34	B1,B101,B107,B108,B13,B134,B136,B140,B16,B23,B40,B60,B66,B70,B71,B74,B90,B92,C11,C19,C28,C34,C43,C53,C56,C62,C65,C69,C74,C79,C83,C87,D4,D5
`Chr1:75118899`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	34	B1,B101,B107,B108,B13,B134,B136,B140,B16,B23,B40,B60,B66,B70,B71,B74,B90,B92,C11,C19,C28,C34,C43,C53,C56,C62,C65,C69,C74,C79,C83,C87,D4,D5
`Chr1:75118986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:75119097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789378.1

361 aa

180

361

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 19-295 aa PF07734 FBA_1 55-202 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789378.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	19	295	3.2e-10	40.3	F-box associated beta propeller domain
`XP_057789378.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	55	202	4.2e-17	62.8	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009095431.1
GCACTAATTAGATTTTAATTAGAATCATATTAACGACTGATCCTCATCTCACTCTCTCTTCTCTCCCTCACCTCTCTAGAGTTGGCGGATTCGCCTGATTGGGTTGCCTTGAAGCGTTATTAAGCTTTGATTCTATAGTACAAGAAAGGGTTGTGGTCTCGGATACGATGCTAAATCCGGCGACTACAAGTTGATACAGAAGTATCACCTATGGTCTTGGTGCAATGTCCGACATCGTTCTGATTATGAAGAGACGAAAA...

XM_057933395.1
GCACTAATTAGATTTTAATTAGAATCATATTAACGACTGATCCTCATCTCACTCTCTCTTCTCTCCCTCACCTCTCTAGAGTTGGCGGATTCGCCTGATTGGGTTGCCTTGAAGCGTTATTAAGCTTTGATTCTATAGTACAAGAAAGATGAATGAGCTTGTTTTGAAATGTTTCGATGGTGGTGGCGATAATAAGGAGTATTATTTATCTATTACGTCTCCCCAAGATATGTCTCCCAAGGAAGGCTTTGAAATTACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006214
ATGAATGAGCTTGTTTTGAAATGTTTCGATGGTGGTGGCGATAATAAGGAGTATTATTTATCTATTACGTCTCCCCAAGATATGTCTCCCAAGGAAGGCTTTGAAATTACCAATCTCTTCTTTTATGATAATGAAAATTATGTTAGTGGTAATATTTGCCGGATGCTGTTGTATTTCTATTATCAAGGCAAAATTGTTCTTTGCAACCTAACAACTAAAGAGCTGAAATTTATTGCTCCGCCGAAGAAACCCATTCAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789378.1
MNELVLKCFDGGGDNKEYYLSITSPQDMSPKEGFEITNLFFYDNENYVSGNICRMLLYFYYQGKIVLCNLTTKELKFIAPPKKPIQCNILFQGCGLGYDAKSGDYKLIQKYHLWSWCNVRHRSDYEETKTELYSLKSCSWKEIPSPDACICAHCGVYVEGSCYWQARLGSAFGGPSSEPALDVLSFDFTSECFSCIPSPTGDDGLTYDLVECRGFLGAIAYESTDEESKCGAKSFELLVWKESSWAKSYVVALYGIENPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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