当前解析结果
SmilChr01G005939| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005939 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005939 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G005939 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 75131935 - 75132477 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131013458 |
|---|---|
| GeneID | 131013458 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131013458 |
| 原始查询 | SmilChr01G005939 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131013458 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057797536.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057797536.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057797536.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057797536.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057797536.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:75131935 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 12 | A5,B12,B140,B33,B47,B55,B69,B77,B91,C36,C65,C75 |
Chr1:75131953 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B136,B23,B40,B48,C62 |
Chr1:75132048 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B28,B71,C59 |
Chr1:75132049 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A1,B129,B26,B99,C81,D3 |
Chr1:75132161 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B43 |
Chr1:75132168 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A10,C31 |
Chr1:75132182 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 16 | A11,A5,B1,B110,B12,B140,B47,B55,B77,B82,B91,C2,C36,C56,C61,C65 |
Chr1:75132185 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B60,B66 |
Chr1:75132246 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,B60,B66 |
Chr1:75132280 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr1:75132289 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,B60,B66 |
Chr1:75132307 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。