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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005945`

染色体: Chr01 坐标: 75190777-75192210 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005945`
名称	SmilChr01G005945
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75190777 - 75192210 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006218`
GeneID	`131006218`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006218`
原始查询	`SmilChr01G005945`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
Arabidopsis	`AT3G23880` (AT3G23880) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821971] identity=29.4; qcov=1.09; evalue=1.45e-27; confidence=low
Rice	`Os12g0164300` (OsFbox646) - identity=26.8; qcov=0.582; evalue=9.55e-13; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006218

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789380.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057789380.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057789380.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789380.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789380.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75190904`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B69
`Chr1:75190904`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B69
`Chr1:75190910`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B125,C6
`Chr1:75190910`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B125,C6
`Chr1:75190980`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A22,A6,B112,B117,B132,B42,B43,B64,C14
`Chr1:75191042`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B12,C56,C61
`Chr1:75191042`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B12,C56,C61
`Chr1:75191140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr1:75191167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A20,A7,B133,B136,B21,B58,B75,B86,B98,C5,C84
`Chr1:75191182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C28,C63,C75
`Chr1:75191206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:75191218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789380.1

352 aa

176

352

F-box

FBA_3

FBA_1

PF00646 F-box 9-48 aa PF08268 FBA_3 88-289 aa PF07734 FBA_1 98-319 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789380.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	9	48	1.2e-10	41.5	F-box domain
`XP_057789380.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	88	289	1.2e-10	41.7	F-box associated beta propeller domain
`XP_057789380.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	98	319	7.8e-19	68.5	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933397.1
CTGCAATTGATTGAATTGGCATTCGCAATTCCCTCTCTATTCTCCCCTCTCTAGAGTTCCGAATTAGGTTGGCTTTTGAAGCGTTAGTATGCTTTAATTCTATAGTATAAGAAAGGAGAAAGTATTTTCGTGTTCGCCGCCATCTATGGAGACCCGAGACATTTACCCATCTCTTTCCAAAGAAATCATCGAAGAAATACTGTTAAGACTACCGGTGAAATCACTCCTGAGATTCAGGTGCGTCTCGAAAGCATGGCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006218
ATGGAGACCCGAGACATTTACCCATCTCTTTCCAAAGAAATCATCGAAGAAATACTGTTAAGACTACCGGTGAAATCACTCCTGAGATTCAGGTGCGTCTCGAAAGCATGGCAATCTCTGATCGACAGCAAACGATTCATCAGAACCCACCTTCAAAATTCGGCAAGAAACCCTAGTTTAGCCCACCACAAGGTTTTGCTGCTCAAATATGTGTCTTCACTGCCAACGCTGTTGCAACGCTCTGTACTCGATAGCTCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789380.1
METRDIYPSLSKEIIEEILLRLPVKSLLRFRCVSKAWQSLIDSKRFIRTHLQNSARNPSLAHHKVLLLKYVSSLPTLLQRSVLDSSDTHDALELEFPVDYIHIVGCCNGLVCLLLDRDRQRQFVLWNPSLRISKKLSETDMMSFFQFYCCGFGWDESSGDYKVFAIAKRASGKSIYWIYTLKSDSWKESEEVKDWDSCKKEDRSRYGESEMGVFASGSLHWETTDRRGVVACDLKREALGAAVELPECSECCRWQGIEVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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