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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005970`

染色体: Chr01 坐标: 75382424-75391606 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005970`
名称	SmilChr01G005970
描述	protein ROS1A-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75382424 - 75391606 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006236`
GeneID	`131006236`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006236`
原始查询	`SmilChr01G005970`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ROS1A-like
产物	protein ROS1A-like
Arabidopsis	`AT5G04560` (DME) HhH-GPD base excision DNA repair family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830335] identity=71.2; qcov=0.289; evalue=0; confidence=weak
Rice	`Os01g0218032` (ROS1A) - identity=69.8; qcov=0.291; evalue=0; confidence=weak
GO	GO:0006284 (base-excision repair); GO:0019104 (DNA N-glycosylase activity); GO:0035514 (DNA demethylase activity); GO:0051539 (4 iron, 4 sulfur cluster binding); GO:0080111 (GO:0080111)
KEGG	-
Pfam	PF15628 (RRM_DME); PF15629 (Perm-CXXC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006236

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789395.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057789395.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789395.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789395.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789395.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75382854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:75382882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr1:75383034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr1:75383206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B49
`Chr1:75383235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr1:75383694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr1:75384218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:75384775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:75384874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C59
`Chr1:75385095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B51,C16
`Chr1:75385177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B77
`Chr1:75385483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789395.1

1865 aa

932

1865

Perm-CXXC

RRM_DME

PF15629 Perm-CXXC 1718-1748 aa PF15628 RRM_DME 1751-1851 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789395.1`	Pfam	`PF15629`	Perm-CXXC	Family	1718	1748	3e-10	40.9	Permuted single zf-CXXC unit
`XP_057789395.1`	Pfam	`PF15628`	RRM_DME	Family	1751	1851	4.2e-52	175.3	RRM in Demeter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933412.1
ATGAACCTGGAGAGGGGATTTCATGATGTTTGGGCTCCGGTGACACCAGAAAAGCCGGTAGAGCAGAGATCGAACCAGGATCATAAAGGAGTCGAAAATTGGCAGGATTTGCTAGGAATTTACACCGGTGTTTTGCAGGACGAAAGCTGTGGGTTGCCTCCGGCATGGCATCCAAACAGCTGTGTAGGCATGAATCCGGTGGAGGTGGAGCCTCCAATCAAGAATTTTGTTCCTGTGCCTCAGAATATCGGGCAAGCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006236
ATGAACCTGGAGAGGGGATTTCATGATGTTTGGGCTCCGGTGACACCAGAAAAGCCGGTAGAGCAGAGATCGAACCAGGATCATAAAGGAGTCGAAAATTGGCAGGATTTGCTAGGAATTTACACCGGTGTTTTGCAGGACGAAAGCTGTGGGTTGCCTCCGGCATGGCATCCAAACAGCTGTGTAGGCATGAATCCGGTGGAGGTGGAGCCTCCAATCAAGAATTTTGTTCCTGTGCCTCAGAATATCGGGCAAGCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789395.1
MNLERGFHDVWAPVTPEKPVEQRSNQDHKGVENWQDLLGIYTGVLQDESCGLPPAWHPNSCVGMNPVEVEPPIKNFVPVPQNIGQAGVVGLHNGHGVASAETCTKMLPCSSGSAGVAGESNWNHGIQDAAPVEKYRSFDQNAGYAGSHLQNVGDMVTPRKVNSLAELMGIGDALGMNGDEITSAAKKAVQKQDIGDYNLQQMPSSRLSAAYRPSYNIDLPQRSEDGDSSSVTMPSHLGPATPDHHKLLKNGEVSQIPHLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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