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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005982`

染色体: Chr01 坐标: 75473032-75475920 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005982`
名称	SmilChr01G005982
描述	receptor-like protein 7
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75473032 - 75475920 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006253`
GeneID	`131006253`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006253`
原始查询	`SmilChr01G005982`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 7
产物	receptor-like protein 7
Arabidopsis	`AT1G47890` (RLP7) receptor like protein 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841206] identity=33.6; qcov=1.09; evalue=2.34e-119; confidence=low
Rice	`Os12g0211500` - identity=35.9; qcov=1.1; evalue=4.31e-143; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF12799 (LRR_4); PF13516 (LRR_6); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006253

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789417.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789417.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789417.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789417.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789417.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75473287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C87,C9
`Chr1:75473296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B4,B51,C29,C51,C56
`Chr1:75473321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C85
`Chr1:75473350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B74,C29
`Chr1:75473371`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A8,B136,B47,B54,B68,B95,C35,C40,C60,C80
`Chr1:75473372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B74,C29
`Chr1:75473373`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A8,B136,B47,B54,B68,B95,C35,C40,C60,C80
`Chr1:75473381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,C1,C23,C85
`Chr1:75473385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B74,C29
`Chr1:75473408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr1:75473539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr1:75473577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789417.1

884 aa

442

884

LRRNT_2

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_6

LRR_1

LRR_4

PF08263 LRRNT_2 30-71 aa PF00560 LRR_1 101-124 aa PF00560 LRR_1 253-275 aa PF13855 LRR_8 277-337 aa PF00560 LRR_1 302-323 aa PF00560 LRR_1 378-399 aa PF00560 LRR_1 402-420 aa PF00560 LRR_1 470-491 aa PF00560 LRR_1 494-513 aa PF00560 LRR_1 516-535 aa PF00560 LRR_1 541-562 aa PF00560 LRR_1 679-697 aa PF00560 LRR_1 699-721 aa PF13855 LRR_8 699-758 aa PF13516 LRR_6 721-736 aa PF00560 LRR_1 723-745 aa PF12799 LRR_4 723-763 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	30	71	2.3e-08	34.9	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	101	124	1.4e-52	164.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	253	275	1.4e-52	164.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	277	337	7.3e-45	151.3	Leucine rich repeat
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	302	323	1.4e-52	164.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	378	399	1.4e-52	164.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	402	420	1.4e-52	164.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	470	491	1.4e-52	164.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	494	513	1.4e-52	164.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	516	535	1.4e-52	164.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	541	562	1.4e-52	164.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	679	697	1.4e-52	164.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	699	721	1.4e-52	164.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	699	758	7.3e-45	151.3	Leucine rich repeat
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	721	736	1.1e-08	35.1	Leucine Rich repeat
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	723	745	1.4e-52	164.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057789417.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	723	763	3.1e-43	145.5	Leucine Rich repeats (2 copies)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933434.1
ATTTAAAGCCACATGCACATATCTCGTACCTGCAACTTTCACAATGCTTCCAAAGCTATTCTTCATCATTATTTCCACACTAATTTCCTCCTTCATTTTCACTACTCATTCATATAATACCCAATGCCTTCACCATCAAAAAACCTTGTTGCTTCAACTCAAGGATGAGCTGATCTTCGATCCTTCTATTTCAACAAAACTTGTGCAATGGAATGAAAGTGATGAGTGCTGCAAGTGGCTCGGTGTGGAATGTGATGCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006253
ATGCTTCCAAAGCTATTCTTCATCATTATTTCCACACTAATTTCCTCCTTCATTTTCACTACTCATTCATATAATACCCAATGCCTTCACCATCAAAAAACCTTGTTGCTTCAACTCAAGGATGAGCTGATCTTCGATCCTTCTATTTCAACAAAACTTGTGCAATGGAATGAAAGTGATGAGTGCTGCAAGTGGCTCGGTGTGGAATGTGATGCTGCTGGCTACGTCGTCAGTTTGCAGCTCGATTATGAGTTCATTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789417.1
MLPKLFFIIISTLISSFIFTTHSYNTQCLHHQKTLLLQLKDELIFDPSISTKLVQWNESDECCKWLGVECDAAGYVVSLQLDYEFISGGIADSSSLFRLVHLQKLNLAYNSFNSSPIPKGIHNLTYLTHLNLSYADFGGQVPAEISSLRRLVSLDISYDFTISVKLEMLVQNLTGLQELYLDHAKVTSPHEKSEWSHIISSYLPNLTTLSLRYCGLSGPLAKPFWQLHSLSILQLDYNNLGTELPDLFANSPSLTTLSLY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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