当前解析结果
SmilChr01G005986| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005986 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005986 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G005986 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 75487391 - 75488624 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006271 |
|---|---|
| GeneID | 131006271 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006271 |
| 原始查询 | SmilChr01G005986 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006271 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.40000 | XP_057789446.1 |
| 2 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057789446.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057789446.1 |
| 4 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057789446.1 |
| 5 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057789446.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:75487464 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 10 | A24,A4,B105,B131,B134,B19,B66,B95,C46,C54 |
Chr1:75487466 |
AGT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B95 |
Chr1:75487466 |
AGT |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr1:75487470 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 7 | B110,B126,B127,B33,B83,C53,D4 |
Chr1:75487477 |
A |
AAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 5 | A24,A4,B134,C46,C54 |
Chr1:75487477 |
A |
AAT |
2bp_insertion | CDS_variant | 5 | A24,A4,B134,C46,C54 |
Chr1:75487478 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B105,B19,B49,B66,B95 |
Chr1:75487478 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | B105,B19,B49,B66,B95 |
Chr1:75487488 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 21 | A2,B105,B120,B125,B131,B133,B136,B137,B140,B19,B66,B78,B80,C16,C20,C32,C43,C77,C86,D2,D7 |
Chr1:75487544 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C1 |
Chr1:75487546 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A24,B33,B53,C33,C61 |
Chr1:75487573 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,B17,C5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。