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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005996`

染色体: Chr01 坐标: 75546946-75548973 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005996`
名称	SmilChr01G005996
描述	receptor-like protein 19
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75546946 - 75548973 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013614`
GeneID	`131013614`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013614`
原始查询	`SmilChr01G005996`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 19
产物	receptor-like protein 19
Arabidopsis	`AT4G13810` (RLP47) receptor like protein 47 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827015] identity=37.7; qcov=0.985; evalue=2.13e-101; confidence=medium
Rice	`Os12g0211500` - identity=40.3; qcov=0.856; evalue=1.45e-113; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13516 (LRR_6); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013614

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797732.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797732.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797732.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797732.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797732.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75546960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B96,C11,C65,C9
`Chr1:75546989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B96,C11,C9
`Chr1:75547018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,C61
`Chr1:75547023`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B8,B94
`Chr1:75547023`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B8,B94
`Chr1:75547029`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A19,B105,B29,C40
`Chr1:75547029`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A19,B105,B29,C40
`Chr1:75547031`	`AGT`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B74,C60,C61,D2
`Chr1:75547074`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B60,B66,B87,C81
`Chr1:75547074`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B60,B66,B87,C81
`Chr1:75547078`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B60,B66,B87,C81
`Chr1:75547078`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B60,B66,B87,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797732.1

675 aa

338

675

LRRNT_2

LRR_1

LRR_6

LRR_1

LRR_6

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 33-74 aa PF00560 LRR_1 126-148 aa PF13516 LRR_6 173-187 aa PF00560 LRR_1 175-189 aa PF13516 LRR_6 217-232 aa PF00560 LRR_1 218-238 aa PF00560 LRR_1 338-356 aa PF00560 LRR_1 362-382 aa PF00560 LRR_1 388-408 aa PF00560 LRR_1 527-548 aa PF13855 LRR_8 527-585 aa PF00560 LRR_1 551-572 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797732.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	33	74	2.2e-07	31.7	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057797732.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	126	148	1.6e-39	126.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057797732.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	173	187	1.3e-08	34.9	Leucine Rich repeat
`XP_057797732.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	175	189	1.6e-39	126.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057797732.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	217	232	1.3e-08	34.9	Leucine Rich repeat
`XP_057797732.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	218	238	1.6e-39	126.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057797732.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	338	356	1.6e-39	126.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057797732.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	362	382	1.6e-39	126.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057797732.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	388	408	1.6e-39	126.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057797732.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	527	548	1.6e-39	126.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057797732.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	527	585	2e-28	98.6	Leucine rich repeat
`XP_057797732.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	551	572	1.6e-39	126.1	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941749.1
ATGCCAATTTCTTTGCTTCAACACCTTTTTCTCATCTCTTTAACTTCAACAATTATTTGCCTAACAAATTGTGGTCATGCATACAAGTTATGCCAAGATGACCAGAAAACATTGTTACTTGAGCTGAAGAAAGACTTGATATTCGATTCTTCTGTTTCAAGAAAACTGGTGCGATGGAATGAGAGGGATGATTGTTGCGAGTGGGAAGGTGTGGGATGCGACGCTACAGGCCATGTTGTGAGTCTGCAACTCGACAACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013614
ATGCCAATTTCTTTGCTTCAACACCTTTTTCTCATCTCTTTAACTTCAACAATTATTTGCCTAACAAATTGTGGTCATGCATACAAGTTATGCCAAGATGACCAGAAAACATTGTTACTTGAGCTGAAGAAAGACTTGATATTCGATTCTTCTGTTTCAAGAAAACTGGTGCGATGGAATGAGAGGGATGATTGTTGCGAGTGGGAAGGTGTGGGATGCGACGCTACAGGCCATGTTGTGAGTCTGCAACTCGACAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797732.1
MPISLLQHLFLISLTSTIICLTNCGHAYKLCQDDQKTLLLELKKDLIFDSSVSRKLVRWNERDDCCEWEGVGCDATGHVVSLQLDNEGISGGIGNSSSLVSLEYLAKLNFAHNSINGRIPTLNLTNLIELDLSSNQLKGPISDSFINLVSLEVLSLSDNLFTSILQLENIQTLHNLTTLNLSHNNLSIEAGSISSQLKKLSLSSCNLQKFPDFLKQSNLNFLDLSQNQITGEVPSWIWEIGNGDLYHLNLSYNVLNDIEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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