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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005998`

染色体: Chr01 坐标: 75564120-75565890 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005998`
名称	SmilChr01G005998
描述	receptor-like protein 50
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75564120 - 75565890 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013642`
GeneID	`131013642`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013642`
原始查询	`SmilChr01G005998`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 50
产物	receptor-like protein 50
Arabidopsis	`AT4G13920` (RLP50) receptor like protein 50 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827026] identity=31.2; qcov=1.11; evalue=3.85e-52; confidence=low
Rice	`Os01g0161300` - identity=35.7; qcov=1.02; evalue=6.17e-51; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13516 (LRR_6); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013642

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797757.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797757.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797757.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797757.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797757.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75564529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr1:75564538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A22,B102,B105,B12,B19,B27,B30,B89,B95,C30,C38,C56,C79,D1
`Chr1:75564613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B35,B55,B90
`Chr1:75564626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C78
`Chr1:75564805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A20,A23,B114,B118,B139,B5,B61,C40,C50,C52
`Chr1:75564826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,A8,B132,B85,C26
`Chr1:75564834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,C17,C48,C61
`Chr1:75564854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C82
`Chr1:75564887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C19,C34,C84
`Chr1:75564933`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	43	A11,A19,A21,A7,B10,B108,B110,B111,B112,B12,B121,B122,B126,B128,B129,B135,B137,B14,B23,B3,B48,B55,B83,B90,B92,B97,C10,C12,C14,C17,C28,C39,C41,C42,C47,C58,C62,C64,C66,C84,C87,D4,D6
`Chr1:75564937`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	43	A11,A19,A21,A7,B10,B108,B110,B111,B112,B12,B121,B122,B126,B128,B129,B135,B137,B14,B23,B3,B48,B55,B83,B90,B92,B97,C10,C12,C14,C17,C28,C39,C41,C42,C47,C58,C62,C64,C66,C84,C87,D4,D6
`Chr1:75564958`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	44	A11,A15,A20,A22,A5,B11,B114,B115,B120,B121,B126,B134,B20,B3,B33,B34,B36,B47,B52,B53,B60,B61,B67,B80,B82,B83,B9,B93,C17,C25,C34,C49,C53,C56,C57,C59,C6,C61,C65,C74,C75,C81,D10,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797757.1

432 aa

216

432

LRRNT_2

LRR_14

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 23-64 aa PF23598 LRR_14 202-403 aa PF00560 LRR_1 203-225 aa PF00560 LRR_1 227-249 aa PF13855 LRR_8 250-310 aa PF00560 LRR_1 251-273 aa PF00560 LRR_1 275-296 aa PF13516 LRR_6 323-336 aa PF00560 LRR_1 324-337 aa PF00560 LRR_1 351-372 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797757.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	23	64	1.9e-06	28.7	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057797757.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	202	403	2.1e-19	70.2	Leucine-rich repeat region
`XP_057797757.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	203	225	8.2e-24	79.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057797757.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	227	249	8.2e-24	79.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057797757.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	250	310	3.1e-25	88.4	Leucine rich repeat
`XP_057797757.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	251	273	8.2e-24	79.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057797757.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	275	296	8.2e-24	79.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057797757.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	323	336	4e-09	36.6	Leucine Rich repeat
`XP_057797757.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	324	337	8.2e-24	79.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057797757.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	351	372	8.2e-24	79.3	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941774.1
ACGATATTGGGATTATCTTTTGCACTTTTTCGCTTCCACACTTGCTTTTCTTCTCTATAATAATCTGGGTAACTATAGCATGCGAAAAAACGTTTGATTAGCTGTGTATTTAAAGCAAATGCATGTATCTTAGCTGCAAGTTTGATTAGTTTGTTTTCACAATGCTTTCAAAGTTGTTTTTCATTTCTTTACTTTCCTCCTTCATTTTCCTTACTCATTCTTGTCTTGACCATCAAAAAACCTTGTTGCTTCAACTCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013642
ATGCTTTCAAAGTTGTTTTTCATTTCTTTACTTTCCTCCTTCATTTTCCTTACTCATTCTTGTCTTGACCATCAAAAAACCTTGTTGCTTCAACTCAAGGATGAGTTGAGCTTCAATTCTTCTCTTTCAACAAAATTGGTGCGATGGAATGTAAGGGATGAGTGCTGCAAGTGGCCCGGTGTGGCATGTGATGCTGCTGGCTACGTCGTTAGTTTGCAGCTCCATAATGAGTCCATTTCTGGTGGAATCGCGGATTCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797757.1
MLSKLFFISLLSSFIFLTHSCLDHQKTLLLQLKDELSFNSSLSTKLVRWNVRDECCKWPGVACDAAGYVVSLQLHNESISGGIADSSSLFRLEYLENLNLAYNKFNCTPIPKGIHNLTYLTHLNLSNAEFGGQVPLQLSFLRRLVCLDISYEYLRTLSIELPNLEMIVQNLTGLRELYLDHVNVTSSHERRKWSHIISSYLPNLTALSLHGCGLSGPLAKSFGQLHSLSFLRLDYNNFGTELPDLFANFPSLTTLSLSSC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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