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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006001`

染色体: Chr01 坐标: 75590073-75592161 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006001`
名称	SmilChr01G006001
描述	receptor like protein 22-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75590073 - 75592161 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013656`
GeneID	`131013656`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013656`
原始查询	`SmilChr01G006001`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor like protein 22-like
产物	receptor like protein 22-like
Arabidopsis	`AT4G13810` (RLP47) receptor like protein 47 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827015] identity=36.4; qcov=0.965; evalue=3.36e-97; confidence=medium
Rice	`Os01g0132100` - identity=39.8; qcov=0.907; evalue=6.23e-118; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13516 (LRR_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013656

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797766.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797766.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797766.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797766.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797766.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75590076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:75590133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A6,A7,B111,B117,B48,C17,C27,C48,C82
`Chr1:75590145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr1:75590158`	`AGT`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr1:75590186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr1:75590196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B52,B66,B80,C60
`Chr1:75590201`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B1,B129,B60,B66,B87,C15,C22,C49,D5
`Chr1:75590205`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B1,B129,B60,B66,B87,C15,C22,C49,D5
`Chr1:75590238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C7
`Chr1:75590280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B38,B39,B4,B43
`Chr1:75590301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,C19,C22
`Chr1:75590347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B108,B91,C30,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797766.1

681 aa

340

681

LRRNT_2

LRR_1

LRR_6

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 33-74 aa PF00560 LRR_1 126-148 aa PF13516 LRR_6 174-187 aa PF00560 LRR_1 175-189 aa PF13516 LRR_6 217-232 aa PF00560 LRR_1 218-238 aa PF00560 LRR_1 362-382 aa PF00560 LRR_1 388-408 aa PF00560 LRR_1 551-571 aa PF00560 LRR_1 575-596 aa PF00560 LRR_1 599-615 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797766.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	33	74	1.7e-07	32.1	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057797766.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	126	148	2.9e-41	131.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057797766.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	174	187	5.4e-08	33.0	Leucine Rich repeat
`XP_057797766.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	175	189	2.9e-41	131.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057797766.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	217	232	5.4e-08	33.0	Leucine Rich repeat
`XP_057797766.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	218	238	2.9e-41	131.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057797766.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	362	382	2.9e-41	131.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057797766.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	388	408	2.9e-41	131.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057797766.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	551	571	2.9e-41	131.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057797766.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	575	596	2.9e-41	131.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057797766.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	599	615	2.9e-41	131.2	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941783.1
ATGCCAATTTCTTTGCTTCAACACCTTTTTCTCATCTCTTTAACTTCAACAATTATTTGCCAAACAAATTGTGGTCATGCATACAAGTTATGCCAAGATGACCAGAAAACATTGTTACTTGAGCTGAAGAAAGACTTGATATTCGATTCTTCTGTTTCAAGAAAACTGGTGCGATGGAATGAGAGCGATGATTGTTGCGAGTGGGAAGGTGTGGGATGCGACGCTGCAGGCCATGTTGTGAGTCTGCAACTCGACAACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013656
ATGCCAATTTCTTTGCTTCAACACCTTTTTCTCATCTCTTTAACTTCAACAATTATTTGCCAAACAAATTGTGGTCATGCATACAAGTTATGCCAAGATGACCAGAAAACATTGTTACTTGAGCTGAAGAAAGACTTGATATTCGATTCTTCTGTTTCAAGAAAACTGGTGCGATGGAATGAGAGCGATGATTGTTGCGAGTGGGAAGGTGTGGGATGCGACGCTGCAGGCCATGTTGTGAGTCTGCAACTCGACAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797766.1
MPISLLQHLFLISLTSTIICQTNCGHAYKLCQDDQKTLLLELKKDLIFDSSVSRKLVRWNESDDCCEWEGVGCDAAGHVVSLQLDNEGISGGIGNSSSLVSLEYLAKLNFAHNSINGSIPTLNLSNLIELDLSSNQLKGPISNSFFNLQSLEVLSLSNNSFNGTFQLENIQRLHNLTTLNLSHNNLSIEAGSISSQLKKLSLSSCNLQKFPDFLKQSNLNFLDLSHNQITGEIPSWIWEIGNGDLYHLNLSYNVLNDLQK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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