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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006003`

染色体: Chr01 坐标: 75601814-75604658 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006003`
名称	SmilChr01G006003
描述	receptor-like protein 19
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75601814 - 75604658 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013662`
GeneID	`131013662`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013662`
原始查询	`SmilChr01G006003`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 19
产物	receptor-like protein 19
Arabidopsis	`AT3G11010` (RLP34) receptor like protein 34 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820272] identity=33.6; qcov=1.06; evalue=1.97e-120; confidence=low
Rice	`Os12g0215950` - identity=35.3; qcov=1.11; evalue=1.96e-142; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013662

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797774.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797774.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797774.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797774.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797774.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75602008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr1:75602029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,C20,C7
`Chr1:75602048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B130,B42,B43,C82
`Chr1:75602050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr1:75602073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr1:75602104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B83,C21
`Chr1:75602188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr1:75602210`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B59
`Chr1:75602210`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B59
`Chr1:75602220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C50
`Chr1:75602220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:75602232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B49,B51,C50,C51,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797774.1

882 aa

441

882

LRRNT_2

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 30-70 aa PF00560 LRR_1 100-122 aa PF13855 LRR_8 250-310 aa PF00560 LRR_1 251-273 aa PF00560 LRR_1 275-292 aa PF00560 LRR_1 300-321 aa PF00560 LRR_1 400-418 aa PF00560 LRR_1 469-488 aa PF00560 LRR_1 493-511 aa PF00560 LRR_1 540-561 aa PF13855 LRR_8 681-733 aa PF00560 LRR_1 698-720 aa PF00560 LRR_1 722-744 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797774.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	30	70	7.5e-07	30.0	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057797774.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	100	122	3.6e-44	139.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057797774.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	250	310	6.7e-41	138.6	Leucine rich repeat
`XP_057797774.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	251	273	3.6e-44	139.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057797774.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	275	292	3.6e-44	139.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057797774.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	300	321	3.6e-44	139.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057797774.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	400	418	3.6e-44	139.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057797774.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	469	488	3.6e-44	139.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057797774.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	493	511	3.6e-44	139.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057797774.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	540	561	3.6e-44	139.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057797774.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	681	733	6.7e-41	138.6	Leucine rich repeat
`XP_057797774.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	698	720	3.6e-44	139.9	Leucine Rich Repeat
`XP_057797774.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	722	744	3.6e-44	139.9	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941791.1
CAAATCACAATACTATCAATTAATAGCCTCTTCATCACAATGCTTCCAAAGTTGTTCTTCGTCATTTCTACACTAATTTCCTCCTTCATTTTCACTACTCATTCTTATAATACCCAATGTCTTCACCATCAGAAAATCTTGTTGCTTCAACTCAAGGATGAGTTGAGTTTCGAATCTCCTCTTTCAACAAAATTGGTGCGATGGAATGAAACGGATGAGTGCTGCAAGTGGCCCGGTGTGGAATGTGATGCTGCTGGCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013662
ATGCTTCCAAAGTTGTTCTTCGTCATTTCTACACTAATTTCCTCCTTCATTTTCACTACTCATTCTTATAATACCCAATGTCTTCACCATCAGAAAATCTTGTTGCTTCAACTCAAGGATGAGTTGAGTTTCGAATCTCCTCTTTCAACAAAATTGGTGCGATGGAATGAAACGGATGAGTGCTGCAAGTGGCCCGGTGTGGAATGTGATGCTGCTGGCTACGTCGTTAGTTTGCAGCTCGATCGTGAGTCCATTTCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797774.1
MLPKLFFVISTLISSFIFTTHSYNTQCLHHQKILLLQLKDELSFESPLSTKLVRWNETDECCKWPGVECDAAGYVVSLQLDRESISGGIEDSSSLFKLVHLQKLNLAYNYFYTPIPRGIHNLTYLTHLNLSAVGFAGQVPPEISSLRRLVSLDMSYDSTNSVKLEMLIQNLTGLRELYLDGVNVTSSQERRKWSHIISSYLPNLTTLSCRECGLSGPLAKSFGQLHSLSILQLDFNHLGSELPDLFANFPSLTTLTLANC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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