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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006013`

染色体: Chr01 坐标: 75719970-75720495 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006013`
名称	SmilChr01G006013
描述	40S ribosomal protein S27-2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75719970 - 75720495 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006274`
GeneID	`131006274`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006274`
原始查询	`SmilChr01G006013`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S27-2
产物	40S ribosomal protein S27-2
Arabidopsis	`AT3G61110` (RS27A) ribosomal protein S27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825283] identity=94.2; qcov=1; evalue=3.1e-58; confidence=high
Rice	`Os02g0478700` - identity=93; qcov=1; evalue=2.94e-48; confidence=medium
GO	GO:0000028 (ribosomal small subunit assembly); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01667 (Ribosomal_S27e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006274

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789449.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057789449.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789449.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789449.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789449.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75720203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B109,B113,B140,B42,B43,B56,B96,C76,C85,C9
`Chr1:75720207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr1:75720252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,D7
`Chr1:75720411`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B45
`Chr1:75720411`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B45
`Chr1:75720426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789449.1

86 aa

Ribosomal_S27e

PF01667 Ribosomal_S27e 30-84 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789449.1`	Pfam	`PF01667`	Ribosomal_S27e	Family	30	84	3.1e-27	94.8	Ribosomal protein S27

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933466.1
CTTCTCTCTCCAGTTCTCACGCCTCTCTCTCTCACTCTCTACAGCCAAGATGGTTCTCTCCAATGATTACGATTTGCTCAATCCACCGGCCGAGCTTGAGAAGAGGAAGCACAAGCTCAAGCGCCTCGTGCAATCCCCCAACTCCTTCTTCATGGATGTCAAGTGTCAGGGTTGCTTTAACATAACCACTGTTTTCAGCCACTCCCAAACCGTTGTTGTGTGTGGAAACTGTCAAACAGTGCTGTGCCAACCCACTGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006274
ATGGTTCTCTCCAATGATTACGATTTGCTCAATCCACCGGCCGAGCTTGAGAAGAGGAAGCACAAGCTCAAGCGCCTCGTGCAATCCCCCAACTCCTTCTTCATGGATGTCAAGTGTCAGGGTTGCTTTAACATAACCACTGTTTTCAGCCACTCCCAAACCGTTGTTGTGTGTGGAAACTGTCAAACAGTGCTGTGCCAACCCACTGGTGGCCGTGCCCGCCTCACCGAGGGCTGCTCCTTCCGAAGAAAGGGCGATTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789449.1
MVLSNDYDLLNPPAELEKRKHKLKRLVQSPNSFFMDVKCQGCFNITTVFSHSQTVVVCGNCQTVLCQPTGGRARLTEGCSFRRKGD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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