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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006021`

染色体: Chr01 坐标: 75794142-75800189 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006021`
名称	SmilChr01G006021
描述	uncharacterized SmilChr01G006021
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75794142 - 75800189 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006250`
GeneID	`131006250`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006250`
原始查询	`SmilChr01G006021`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0107400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0107400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G22060` (AT1G22060) sporulation-specific protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838811] identity=41; qcov=0.13; evalue=1.51e-23; confidence=weak
Rice	`Os03g0107400` - identity=35.1; qcov=0.589; evalue=1.46e-68; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10358 (NT-C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006250

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057789415.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057789415.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057789415.1`
4	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057789415.1`
5	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057789415.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75796140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B111,B124,B95
`Chr1:75797312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B115,B122,B20
`Chr1:75797313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B115,B122,B20
`Chr1:75797809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C58
`Chr1:75797852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B42,B43
`Chr1:75797869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:75797917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B106,B123,B49,D7
`Chr1:75798088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B115,B122,B20
`Chr1:75798216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B104,D9
`Chr1:75798225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B60,B71,C62,C75
`Chr1:75798319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B60,B71,C75
`Chr1:75798374`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B16,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789415.1

978 aa

489

978

NT-C2

PF10358 NT-C2 27-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789415.1`	Pfam	`PF10358`	NT-C2	Domain	27	149	4.8e-13	49.7	N-terminal C2 in EEIG1 and EHBP1 proteins

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933432.1
ATAGTATTCTCATCAAAGCATACAAAGCTCGATTCTTGCAACAACTATATAATAAAAGAAGGGAGTACCGTATGCATGCGCACGTTAACCAGTGATAAAACAGTCAATGTCTGAGATTAAAGGTCTCGATTCCGACTCGACCTTCACCCAATCTCTAAAAATTTATTTATCCAAATATAGAGAGAAGAGAGCACGTACTAACTAACGGGGAATCTCTTGTGAAGAAGAGGCAAAACAATGATTGAATAGGTGAAAAAGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006250
ATGATAAGAGAAAAGATTCTCAGACTTCACAGACACAAGTCTTCATCATCGTACTCATCAGCCGCCACCGATGCATCTGCTCAGAAATTCGATTTCATTTTCTCCAACATTCAAGCAACTCAGGTACCAAAAGGATGGGAAAAAATCTATGTCTCTCTCATCTCTCTAGAATCAGGAAAAACAGTGCGTAAATCAGTCAAGGTAAATGTGAAAAATGGGAGCTGTAAATGGACAGAAACCTTTGCAGAATCAATATGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789415.1
MIREKILRLHRHKSSSSYSSAATDASAQKFDFIFSNIQATQVPKGWEKIYVSLISLESGKTVRKSVKVNVKNGSCKWTETFAESIWISDIDMDECLFKILVATGSSKSSILGEAKLNLAAFLSSESSVLLSLPLKKCNYGTVLQVEVKCLTPKTNPRDEKLKGMNAAKDENADHDTIEIQSEASESLSRNNIGRETSYSFDSMDDSVGRQSYSSQSERFGRQDSIESSESSSYGSYSAHGSVKSVRSLQSHGRNQREEFR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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