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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006026`

染色体: Chr01 坐标: 75831035-75834081 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006026`
名称	SmilChr01G006026
描述	prohibitin-1, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75831035 - 75834081 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006281`
GeneID	`131006281`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006281`
原始查询	`SmilChr01G006026`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	prohibitin-1, mitochondrial-like
产物	prohibitin-1%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT1G03860` (PHB2) prohibitin 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839228] identity=75.7; qcov=0.914; evalue=5.19e-148; confidence=high
Rice	`Os03g0841700` - identity=79.7; qcov=0.935; evalue=2.18e-156; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0007005 (mitochondrion organization); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01145 (Band_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006281

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057789456.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.80000	`XP_057789456.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.80000	`XP_057789456.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057789456.1`
5	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057789456.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75831687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C34,C53
`Chr1:75831732`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B3,B4,B54,C15,C21,C42,C47
`Chr1:75832936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr1:75833434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B3,B4,B54,C12,C15,C21,C42
`Chr1:75833670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B24,C23
`Chr1:75833742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B140,B71,C48
`Chr1:75833769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789456.1

279 aa

140

279

Band_7

PF01145 Band_7 32-209 aa

XP_057789457.1

279 aa

140

279

Band_7

PF01145 Band_7 32-209 aa

XP_057789458.1

279 aa

140

279

Band_7

PF01145 Band_7 32-209 aa

XP_057789459.1

279 aa

140

279

Band_7

PF01145 Band_7 32-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789456.1`	Pfam	`PF01145`	Band_7	Domain	32	209	3.9e-33	115.6	SPFH domain / Band 7 family
`XP_057789457.1`	Pfam	`PF01145`	Band_7	Domain	32	209	3.9e-33	115.6	SPFH domain / Band 7 family
`XP_057789458.1`	Pfam	`PF01145`	Band_7	Domain	32	209	3.9e-33	115.6	SPFH domain / Band 7 family
`XP_057789459.1`	Pfam	`PF01145`	Band_7	Domain	32	209	3.9e-33	115.6	SPFH domain / Band 7 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933473.1
AAATGCAGAAAAATAGAGAGGAAAATACCCTTTTTTTAAATAAAAATAATAATAATAACACAAAACCCCTTTTCCAAGACACCGATTTCCGACTTAAACCCTTTTCAGCTGCTATTCGACGCCACCTTTTTTCTCAAGATTCCTCAGCTTCTTTTTTGTGAAGTGATTTAGTGGACGATAATGGCGGCTGGCAATGTTCCAGTTCCACGTGGTTTGGTCGGTGTGGGACTTCTCGCCGGGATTGGGCTCTTTGGACTCAG...

XM_057933475.1
TACAAATTTCCACTGTTTGTGTTCTGGCTATGCAAATCCACACGTAGTAACAGTGTTTACTGAAAGCTGAATTTTATCCGCTTTTGGATTTTTTATTTTTAGCTTTTTTCTGATACTGAAATAGTGATTTAGTGGACGATAATGGCGGCTGGCAATGTTCCAGTTCCACGTGGTTTGGTCGGTGTGGGACTTCTCGCCGGGATTGGGCTCTTTGGACTCAGTCAAGGTCTCTACAATGTTGAGGGAGGGCACCGTGCGAT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131006281
ATGGCGGCTGGCAATGTTCCAGTTCCACGTGGTTTGGTCGGTGTGGGACTTCTCGCCGGGATTGGGCTCTTTGGACTCAGTCAAGGTCTCTACAATGTTGAGGGAGGGCACCGTGCGATTGTTTTCAGTCGTTTTGGTGGGATCAGGGATCAGGTCTATCCTGAAGGAACACATTTTAGGATCCCGTGGTTTGACAGGCCAATCATTTACGATGTTCGAGCACGACCTCATCTGGTGGAGAGCACCTCTGGCAGTCGCGA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057789456.1
MAAGNVPVPRGLVGVGLLAGIGLFGLSQGLYNVEGGHRAIVFSRFGGIRDQVYPEGTHFRIPWFDRPIIYDVRARPHLVESTSGSRDLQMVKIGLRVLTRPVPDQLPSIYRTLGENFNERVLPSIIHETLKAVVAQYNASQLITQRENVSREIRQILTQRAANFDIALDDVSLTSLTFGKEFTNAIEAKQIAAQEAERAKFVVEKAEQDKQSAIIRAQGEAKSAQLIGQAIASNPAFITLRRIEASKDISSTVSSSTNKV...

XP_057789457.1
MAAGNVPVPRGLVGVGLLAGIGLFGLSQGLYNVEGGHRAIVFSRFGGIRDQVYPEGTHFRIPWFDRPIIYDVRARPHLVESTSGSRDLQMVKIGLRVLTRPVPDQLPSIYRTLGENFNERVLPSIIHETLKAVVAQYNASQLITQRENVSREIRQILTQRAANFDIALDDVSLTSLTFGKEFTNAIEAKQIAAQEAERAKFVVEKAEQDKQSAIIRAQGEAKSAQLIGQAIASNPAFITLRRIEASKDISSTVSSSTNKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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