当前解析结果
SmilChr01G006035| 统一新 Gene ID | SmilChr01G006035 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G006035 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G006035 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 75867731 - 75869173 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006295 |
|---|---|
| GeneID | 131006295 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006295 |
| 原始查询 | SmilChr01G006035 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006295 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057789476.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057789476.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057789476.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789476.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789476.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:75868088 |
C |
CAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 9 | B10,B126,B44,B58,B60,B72,B82,C15,C24 |
Chr1:75868089 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 9 | B10,B126,B44,B58,B60,B72,B82,C15,C24 |
Chr1:75868109 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 23 | A23,A9,B1,B102,B123,B125,B140,B24,B26,B59,B68,B69,B81,B90,B91,B92,C2,C40,C46,C62,C7,C70,D11 |
Chr1:75868117 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B10,C59,D4 |
Chr1:75868117 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 3 | B10,C59,D4 |
Chr1:75868119 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 23 | A23,A9,B1,B102,B123,B125,B140,B24,B26,B59,B68,B69,B81,B90,B91,B92,C2,C40,C46,C62,C7,C70,D11 |
Chr1:75868122 |
T |
TC |
1bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 32 | A1,A23,A9,B1,B102,B123,B125,B137,B140,B24,B26,B55,B57,B59,B68,B69,B71,B78,B81,B88,B90,B91,B92,C14,C2,C23,C40,C46,C62,C7,C70,D11 |
Chr1:75868134 |
GCT |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 32 | A1,A23,A9,B1,B102,B123,B125,B137,B140,B24,B26,B55,B57,B59,B68,B69,B71,B78,B81,B88,B90,B91,B92,C14,C2,C23,C40,C46,C62,C7,C70,D11 |
Chr1:75868402 |
TCA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B96 |
Chr1:75868402 |
TCA |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B96 |
Chr1:75868504 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | A20,B117,B17,B19,B47,B75,B9,C1,C36,C5,C58 |
Chr1:75868572 |
CTT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 16 | A1,B137,B38,B39,B55,B57,B61,B71,B78,B8,B88,C12,C14,C23,C3,C55 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。