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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006048`

染色体: Chr01 坐标: 75988937-75990754 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006048`
名称	SmilChr01G006048
描述	uncharacterized SmilChr01G006048
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75988937 - 75990754 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006302`
GeneID	`131006302`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006302`
原始查询	`SmilChr01G006048`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837706]; symbol=AT1G11620; hit=AT1G11620; species=arabidopsis; confidence=low
产物	F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837706]; symbol=AT1G11620; hit=AT1G11620; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G11620` (AT1G11620) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837706] identity=28.5; qcov=0.366; evalue=5e-10; confidence=low
Rice	`Os09g0447600` - identity=30.8; qcov=0.272; evalue=1e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006302

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789478.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789478.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789478.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789478.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789478.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75989249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr1:75989479`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A22,B27,B35,B82,B89,C38,C44,C78
`Chr1:75989620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B132,C44
`Chr1:75989645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B132,C44
`Chr1:75989671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr1:75989889`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C62
`Chr1:75989889`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C62
`Chr1:75989955`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A11,A25,B102,B106,B123,B74,B87,B99,C17,C25,C33,C41,C48,C60,C61,D8,D9
`Chr1:75990103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B135,B138,B28,C18
`Chr1:75990122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:75990174`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B105,B112,B136,B41,B7,B89,C39,C79,C81,C87
`Chr1:75990220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789478.1

489 aa

244

489

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 21-214 aa PF07734 FBA_1 48-267 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789478.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	21	214	5.9e-14	52.5	F-box associated beta propeller domain
`XP_057789478.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	48	267	1.7e-23	83.8	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933495.1
AAATTCCATGTCCATCTCTTCTAAGTTGTAACCCTTGTCAAATTAATCCTTTTTCAAAATTCCACAATCGTCTCCTCCCAAATTTTCATCGATCTAACCCTTCTCAAATCGAGCCTCCAACCTTCTTCACGAGGTATGGATCGACTTCTTCTGAAACGCACGTATCATGCCGATGGCGGTGATGGGCATTCTTTATCTTTACTTTCTCCGCAAGGCCGGTCTGTGTGTGAAGACTATCAAAATCTCCTTCTCCCCTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006302
ATGGATCGACTTCTTCTGAAACGCACGTATCATGCCGATGGCGGTGATGGGCATTCTTTATCTTTACTTTCTCCGCAAGGCCGGTCTGTGTGTGAAGACTATCAAAATCTCCTTCTCCCCTTCTCCAAAACAAGTTGTGTTCGTGGCAGTAGTTGTGGTGGATTGTTATACTTTGACAATTTTAGGGGCAAAATTATTATTTGCAATCCAACAACTAGGGCGATGAAACTCCTTGATCCCCCTCAGATGCGACATTATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789478.1
MDRLLLKRTYHADGGDGHSLSLLSPQGRSVCEDYQNLLLPFSKTSCVRGSSCGGLLYFDNFRGKIIICNPTTRAMKLLDPPQMRHYSDAIINFECSGFGYDHKSDDYKVVRVFDYLYHYCTVKMKNPCRYCRGGGKTEMKVEVFSLKTDSWKQIKVAADFDLDGISSSSECYVNGSCYWIKLNHRDDTLFHYSVLSFDFTRECFSTNISLPPIHKDNEHLLDCDILVKVHDDMVGVIRYERASQSFGVVTTFRLLVLKES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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