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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006051`

染色体: Chr01 坐标: 76012785-76016993 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006051`
名称	SmilChr01G006051
描述	uncharacterized SmilChr01G006051
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76012785 - 76016993 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006303`
GeneID	`131006303`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006303`
原始查询	`SmilChr01G006051`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0295700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0295700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G58510` (AT5G58510) Rab3 GTPase-activating protein catalytic protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835964] identity=68.6; qcov=0.173; evalue=2.42e-17; confidence=weak
Rice	`Os03g0295700` - identity=39.2; qcov=0.485; evalue=3.5e-18; confidence=low
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0043547 (positive regulation of GTPase activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006303

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057789479.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057789479.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057789479.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789479.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789479.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76013055`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C11
`Chr1:76013055`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C11
`Chr1:76013262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B4
`Chr1:76013313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B67,B87
`Chr1:76013326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C54
`Chr1:76015254`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A20,B134,B138,B41,B51,B60,B62,B71,B93,C21,C42,C51,C62,C71,C73,C79
`Chr1:76015274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr1:76015588`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B38,B39,B61
`Chr1:76015588`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B38,B39,B61
`Chr1:76016079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009095449.1
GTGAATTGATCCTAACAAAATCAGAAGACGAATAAAAAGAAAAACTTAGTCCAAAGAAAAGCATCGGTAGTTAGGGCATGGGAATGAAGGGGTTTAACGTGATCGCCGCATTCGTGGTGGTTTTCTCATTGCTGATCGCCGCATTCGTCGTCTTCTCATTGCTGTCTTTCGGCGGCCATGACCATGGCGATGGCGATGCTTCAGATTTCAATTCCGATCCATCATTTAATTTTGAGTTTAAATCTGGTACAGAATTTTAT...

XM_057933496.1
GTGAATTGATCCTAACAAAATCAGAAGACGAATAAAAAGAAAAACTTAGTCCAAAGAAAAGCATCGGTAGTTAGGGCATGGGAATGAAGGGGTTTAACGTGATCGCCGCATTCGTGGTGGTTTTCTCATTGCTGATCGCCGCATTCGTCGTCTTCTCATTGCTGTCTTTCGGCGGCCATGACCATGGCGATGGCGATGCTTCAGATTTCAATTCCGATCCATCATTTAATTTTGAGTTTAAATCTGGTACAGAATTTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006303
ATGGGAATGAAGGGGTTTAACGTGATCGCCGCATTCGTGGTGGTTTTCTCATTGCTGATCGCCGCATTCGTCGTCTTCTCATTGCTGTCTTTCGGCGGCCATGACCATGGCGATGGCGATGCTTCAGATTTCAATTCCGATCCATCATTTAATTTTGAGTTTAAATCTGGTACAGAATTTTATTTGGATTGCTTAAGGCATTACGCACGTGTTGAACGTGAAGACTTCTGGCCCGATAGCCCCAGCGAGGAGGACTTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789479.1
MGMKGFNVIAAFVVVFSLLIAAFVVFSLLSFGGHDHGDGDASDFNSDPSFNFEFKSGTEFYLDCLRHYARVEREDFWPDSPSEEDFLSDINWQVGNACRYGIESVEDAYRGIGRLSPDYVEALNIWFKGNQTLTQLEICRIDPNRCPQHAANLFKLFWDGQLPPISVLWIEFVREVCWCWEESQPLPRMPSNGPIDLSTCLINQKLHTEDPQSPSDISSSHGTSKEGSGRKDQDPQSPADISSSHGASKEGSGRKDDSND...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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