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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006055`

染色体: Chr01 坐标: 76025012-76026311 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006055`
名称	SmilChr01G006055
描述	zinc finger protein ZAT5
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76025012 - 76026311 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006306`
GeneID	`131006306`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006306`
原始查询	`SmilChr01G006055`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein ZAT5
产物	zinc finger protein ZAT5
Arabidopsis	`AT5G03510` (AT5G03510) C2H2-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831818] identity=37.3; qcov=1.09; evalue=8.7e-45; confidence=medium
Rice	`Os02g0823900` (OsSTA83) - identity=32.9; qcov=1.21; evalue=1.67e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13894 (zf-C2H2_4); PF13912 (zf-C2H2_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006306

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789482.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789482.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789482.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789482.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789482.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76025312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:76025378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:76025436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,C42,C64,C66
`Chr1:76025540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B17
`Chr1:76025596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:76025607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:76025627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C59
`Chr1:76025679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr1:76025681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B25,B65,D4
`Chr1:76025796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr1:76025978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:76026097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,C42,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789482.1

279 aa

140

279

zf-C2H2_6

zf-C2H2_4

PF13912 zf-C2H2_6 116-141 aa PF13912 zf-C2H2_6 192-217 aa PF13894 zf-C2H2_4 193-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789482.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	116	141	7.3e-25	87.1	C2H2-type zinc finger
`XP_057789482.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	192	217	7.3e-25	87.1	C2H2-type zinc finger
`XP_057789482.1`	Pfam	`PF13894`	zf-C2H2_4	Domain	193	215	2.8e-09	37.6	C2H2-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933499.1
TGTCCCCCTAATCTCCTTCAAACCTCCACCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCATTTCTCCCTCCCTCCTCTCTCCTCCCCCCTCTCTCTCTTCTCTCTCCCACTCTACAAAAGTTAAACACCAACAAGTGCCATAGCAGTTCCCATCACGGTGATGGTGGCGGAGGCAAATGGAGACTGTGGAGGAGGAAGTGGTGGTGGCGCCGCCGTGCCACAATAATGACCTGTCCCCGGTCGCCAAAGGCAAGCGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006306
ATGGAGACTGTGGAGGAGGAAGTGGTGGTGGCGCCGCCGTGCCACAATAATGACCTGTCCCCGGTCGCCAAAGGCAAGCGCACCAAGAGACAGAGACCTCATTCACCTATTCCCTTCACCGTCAACAACCACCGCCTTAGTCCCAGCTTCTCCGCCGCCTCCGCGGCGGACAGCACCACCACGGAGGAGGAGGACACCGCCCGATGCTTGATCCTCCTCTCCCGCGGCCATTTTCTCCCCATTCAAAAATCCCACCACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789482.1
METVEEEVVVAPPCHNNDLSPVAKGKRTKRQRPHSPIPFTVNNHRLSPSFSAASAADSTTTEEEDTARCLILLSRGHFLPIQKSHHDHPQQYHSKPTKPTADRGGGAAAAGGGGMYACKTCNRVFSSFQALGGHRTSHKKPKNDKKTASFPDFDDDFPSPPSTSKKRIPPSLSLQLSSTAGGGGRQLPSPRVHECSYCGAEFASGQALGGHMRRHRAGPASPLPEPKKPRNGLSLDLNFPAPEDESQRFGYGGGSARREK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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