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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006056`

染色体: Chr01 坐标: 76027185-76030307 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006056`
名称	SmilChr01G006056
描述	SHUGOSHIN 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76027185 - 76030307 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006307`
GeneID	`131006307`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006307`
原始查询	`SmilChr01G006056`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SHUGOSHIN 2-like
产物	SHUGOSHIN 2-like
Arabidopsis	`AT5G04320` (AT5G04320) Shugoshin C terminus [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830311] identity=29; qcov=1.05; evalue=5.47e-32; confidence=low
Rice	`Os02g0799100` (OsSGO1) - identity=46.2; qcov=0.212; evalue=1.09e-18; confidence=weak
GO	GO:0000775 (chromosome, centromeric region); GO:0005634 (nucleus); GO:0034090 (maintenance of meiotic sister chromatid cohesion); GO:0045144 (meiotic sister chromatid segregation)
KEGG	-
Pfam	PF07557 (Shugoshin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006307

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789483.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057789483.1`
3	Centromere	着丝粒	0.20000	`XP_057789483.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057789483.1`
5	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057789483.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76027365`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A3,B110
`Chr1:76027365`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A3,B110
`Chr1:76027443`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B132,B38,B39,C8
`Chr1:76027443`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B132,B38,B39,C8
`Chr1:76027519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:76028050`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	56	A13,A14,B1,B105,B111,B112,B123,B125,B126,B127,B131,B133,B15,B24,B26,B27,B30,B42,B43,B5,B50,B57,B6,B69,B72,B81,B84,B86,B89,B97,C13,C15,C2,C20,C22,C27,C37,C39,C40,C41,C47,C5,C54,C58,C67,C7,C74,C75,C79,C80,C81,C83,D10,D11,D2,D3
`Chr1:76028604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr1:76028839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:76028843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,B57,C75
`Chr1:76028854`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	90	A11,A14,A16,A18,A20,A21,A23,A25,A3,A4,A6,B104,B107,B109,B110,B115,B121,B122,B124,B127,B128,B13,B130,B134,B140,B19,B22,B26,B30,B34,B38,B39,B46,B48,B50,B51,B59,B61,B63,B65,B67,B68,B69,B7,B71,B78,B8,B83,B84,B9,B90,B94,B97,C1,C15,C16,C18,C28,C29,C30,C31,C37,C38,C40,C41,C44,C45,C47,C48,C49,C50,C51,C53,C54,C59,C63,C65,C7,C72,C74,C77,C78,C79,C8,C85,C86,D1,D2,D5,D6
`Chr1:76028874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:76028879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	114	A11,A14,A16,A18,A20,A21,A22,A23,A25,A3,A4,A5,A6,A9,B102,B104,B107,B109,B110,B112,B114,B115,B118,B121,B124,B126,B127,B128,B13,B130,B134,B135,B136,B14,B140,B19,B2,B22,B23,B26,B30,B31,B32,B34,B35,B38,B39,B46,B49,B50,B55,B59,B61,B62,B63,B65,B68,B69,B7,B71,B77,B78,B8,B80,B84,B86,B87,B9,B90,B94,B97,C1,C15,C16,C22,C25,C29,C3,C30,C31,C37,C38,C40,C41,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C53,C54,C59,C65,C66,C7,C72,C74,C77,C79,C8,C84,C85,C86,C87,D1,D11,D2,D3,D5,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789483.1

438 aa

219

438

Shugoshin_C

PF07557 Shugoshin_C 413-437 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789483.1`	Pfam	`PF07557`	Shugoshin_C	Motif	413	437	3.1e-07	30.8	Shugoshin C terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933500.1
GAAGTAGGCTCGGGATTTGCTCCGGAATGCCGTTCGCCATGTCCTAGCCTCCTTCCCTCTTATTTTTATTTCCTTACCTCATTTCAAATCCAGGCACCCCCCCACCCTACCCCCACCCCACCAGAGTGAGAGATGAAGAGCGATGGCTAATTAGGCCTAAAGCGCTGTACAGATAGAGAGAGAGAACCGTGTAGTGAGAGAGTCGGGAAGCAACAACGATGTCGGAGAGGGATGGTTTTCTGAATCTCGACACGCAGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006307
ATGTCGGAGAGGGATGGTTTTCTGAATCTCGACACGCAGAATGCTGCTGCAATTGGATGTTATAATAAAGACGAGAAAGCAGCTAGGCTGTGCCCTCAGAATTTGGCCAGGCGGAAGCTGGCTGACATTAGCAACTTGCCTCAGAGTAGGCTGTTGATTCAAGACCAGAAGTCTCAGTCGATTCCTACAACTACTAAAGAGTATATTGAGCAGCTCCAGAAGGAAAATTTGGCTTTGGCGAAGATGTTGGCGCAGAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789483.1
MSERDGFLNLDTQNAAAIGCYNKDEKAARLCPQNLARRKLADISNLPQSRLLIQDQKSQSIPTTTKEYIEQLQKENLALAKMLAQRNKIIEQSGIELERLRSNLIKMREQNQQLALSHTLMLAELNSGKDRLKTLQHELGCKNGLLKARNSKLEVNLIEEEDPSKDHKKPRNAKKRLRSLSLGSSEQSQSKDNAGNRLPTRRQSARFKAVEPDDDSLSEMYDSKIPKCPLPDGTSPSTSVDALANNEDHVAKRPSVRRQS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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