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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006057`

染色体: Chr01 坐标: 76033974-76039301 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006057`
名称	SmilChr01G006057
描述	probable pectate lyase 5
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76033974 - 76039301 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006308`
GeneID	`131006308`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006308`
原始查询	`SmilChr01G006057`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectate lyase 5
产物	probable pectate lyase 5
Arabidopsis	`AT5G04310` (AT5G04310) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830310] identity=63.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0457200` (DEL1) - identity=68.2; qcov=0.794; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0030570 (pectate lyase activity)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00544 (Pectate_lyase_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006308

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057789484.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057789484.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789484.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789484.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789484.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76034990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B112,B81
`Chr1:76035070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C87,C9
`Chr1:76035097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:76035163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B112,B81
`Chr1:76035556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:76035598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,D11
`Chr1:76039032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:76039040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789484.1

499 aa

250

499

Pectate_lyase_4

PF00544 Pectate_lyase_4 152-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789484.1`	Pfam	`PF00544`	Pectate_lyase_4	Repeat	152	354	4.4e-25	89.2	Pectate lyase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933501.1
AAGAAAGCAACAAATATTTCATTTCAAAAATCTCCACAATTTCCACTACACTATTTCAAAAAATAAAAAATGATACCCTGCATCATTATAGATGATAAACACATTGATTTTTATTTATATAAATGATGACACAATTTCCCAAATTCCCTATCTAAGGAAGCAAGAAATCTCTTCCTTGGAGAGTCTCTTTCACAAGAAACCCAATAACACATCATATACTCTTCCTCTCTCCCTCCCTCCATTCTTTAATTTCTGACAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006308
ATGCTTCCTCAATTCTGCATTCTCTTGTTTTGCATCTTCTTCCTCTCTCTCTCTTCATTTATCTCATCCTACAATCTCTCTCTCCCCCATCAACACCCTGACCCTGAAGCTGTTGTCCAGCATGTGCAGAGGAGTGTTAATGCCTCATTTTCAAGAAGGCATGAGCTCCTCTCCGCCCCAATCCCAACCGGCATTGCCCAATGCCTCACCGGAAACCCCATCGACGACTGCTGGCGCTGCGACCCCAATTGGGGCTCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789484.1
MLPQFCILLFCIFFLSLSSFISSYNLSLPHQHPDPEAVVQHVQRSVNASFSRRHELLSAPIPTGIAQCLTGNPIDDCWRCDPNWGSNRQRLADCAIGFGRGAKGGMGGRYYVVTDSSDRDAENPIPGTLRHAVIQDEPLWIIFQSSMVIKLKHELIFNSYKTVDGRGANVHITGNGCITLQYVSNVIIHNVHIYNCVPSGNTIVRSSPSHAGWRGKSDGDGISIFSSRNIWIDHCALSHCTDGLIDAIMGSTAITISNSY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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