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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006058`

染色体: Chr01 坐标: 76039776-76042640 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006058`
名称	SmilChr01G006058
描述	serine/threonine protein phosphatase 2A 57 kDa regulatory subunit B' beta isoform-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76039776 - 76042640 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006309`
GeneID	`131006309`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006309`
原始查询	`SmilChr01G006058`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine protein phosphatase 2A 57 kDa regulatory subunit B' beta isoform-like
产物	serine/threonine protein phosphatase 2A 57 kDa regulatory subunit B' beta isoform-like
Arabidopsis	`AT5G03470` (ATB' ALPHA) Protein phosphatase 2A regulatory B subunit family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831828] identity=64.3; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0681800` (OSJNBb0070O09.3) - identity=64.5; qcov=0.889; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000159 (protein phosphatase type 2A complex); GO:0007165 (signal transduction); GO:0019888 (protein phosphatase regulator activity)
KEGG	smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04382 (Cornified envelope formation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01603 (B56)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006309

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789485.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057789485.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057789485.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789485.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789485.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76041192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr1:76041630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr1:76041663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,C5,D10
`Chr1:76041793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B48,B53,C51,D9
`Chr1:76041966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B48,B53,C51,D9
`Chr1:76041970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr1:76041999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B53,C51,D9
`Chr1:76042008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,C64,C66
`Chr1:76042102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789485.1

476 aa

238

476

B56

PF01603 B56 61-471 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789485.1`	Pfam	`PF01603`	B56	Repeat	61	471	2.2e-175	584.3	Protein phosphatase 2A regulatory B subunit (B56 family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009095451.1
CTTTTTTTCGGATCTTTGTTTCCCAAATCAATACACGCAATTCTCTCTCACCTCGCCTCATACGTTTTTTTCTCTCTCATGTCGTTGATTTCCAGATTTTCATTTGGCTTTCTCAATTTTCAGCCCATCTCATTTGAGGTGCAGAATTTGTATGCAAATTGGTTTGGTTACGATTATGTAGGAAATGTTGAAAATGAGAATGAAATTGATGAGGAAATGTAAAAGAAGGAGAAAATGGGTCTGAATTGGGGAAAACATAG...

XM_057933502.1
CTTTTTTTCGGATCTTTGTTTCCCAAATCAATACACGCAATTCTCTCTCACCTCGCCTCATACGTTTTTTTCTCTCTCATGTCGTTGATTTCCAGATTTTCATTTGGCTTTCTCAATTTTCAGCCCATCTCATTTGAGGTGCAGAATTTGTATGCAAATTGGTTTGGTTACGATTATGTAGGAAATGTTGAAAATGAGAATGAAATTGATGAGGAAATGTAAAAGAAGGAGAAAATGGGTCTGAATTGGGGAAAACATAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006309
ATGTTTAACAAAATAATGAAAAGGGGGAAAAAGTCCTCAAAGGAATCAATTGAGGCACCAGTTCCCGCACCAGCACCTCCACCGTCTAATGTGACAGTCAATCATGCATCACGGACGAACGTGACGCCGAAGCCAACGGCTGGTCCCGTCGTCCCACCGAGGCCGGCCACGGTGGAGGTGTTGCCAAATTTGAAGGATACCCCATTAAATGAGAAACATGGGGTGTTCATCAGGAAGGTCCATGTGTGCTGTTTTTTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789485.1
MFNKIMKRGKKSSKESIEAPVPAPAPPPSNVTVNHASRTNVTPKPTAGPVVPPRPATVEVLPNLKDTPLNEKHGVFIRKVHVCCFFFDFVDTMKSAREKEIKRQTLAELIDIVQTGSCKMNEIMQDEMVKMIALNIFRSLPPAAHEATGGPGGDPEEDEMYMEPAWPHLQLVYELLLRYVVSSDTDTKIAKRYLDHSFVLKLLDLFDCEDIREREYLKTILHRIYGRFMVHRPYIRTAMNNILYRFIFETERYGGVNELL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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