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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006060`

染色体: Chr01 坐标: 76046944-76048345 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006060`
名称	SmilChr01G006060
描述	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 31 kDa protein-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76046944 - 76048345 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006311`
GeneID	`131006311`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006311`
原始查询	`SmilChr01G006060`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 31 kDa protein-like
产物	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 31 kDa protein-like
Arabidopsis	`AT3G10400` (U11/U12-31K) RNA recognition motif and CCHC-type zinc finger domains containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820203] identity=63.1; qcov=1.02; evalue=6.61e-78; confidence=high
Rice	`Os09g0549500` - identity=61.6; qcov=1.03; evalue=3.57e-89; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005689 (U12-type spliceosomal complex); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF00098 (zf-CCHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006311

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789488.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057789488.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057789488.1`
4	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057789488.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789488.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76047093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr1:76047094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr1:76047256`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C1
`Chr1:76047256`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C1
`Chr1:76047299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B76,B90
`Chr1:76047340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B70,B75
`Chr1:76047346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,C34,C40
`Chr1:76047365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C34,C35
`Chr1:76047395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C40
`Chr1:76047410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,D7
`Chr1:76047418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:76047451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789488.1

258 aa

129

258

RRM_1

zf-CCHC

PF00076 RRM_1 52-122 aa PF00098 zf-CCHC 146-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789488.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	52	122	1.2e-19	70.6	RNA recognition motif
`XP_057789488.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	146	161	9.2e-06	26.2	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933505.1
TGTAAATACTTGTTTTGTTTAAATGGGCTGATTGTTGGAAATGACACATTTGATCCAAATTTGTACGTAATTTTCATGCAACTACCATTTACAAGTTTGATTTAACTTTTGGTTTTTTCCAACAATTAATTCTATATATTCTGGCATCCTTGTTCGAAGTTGTGAGTGAGATAAACTCGGATCAAAAGTCTACCAACGCAGTTATTTTGGATCAAAATTATTTCATTTTATAATTAAAAAAACTTAAAGATAATGGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006311
ATGCCTCGGAAGAGAAACCAGAGCGACGACGAAGAGGACGATACCTTCTTCTACCGCTACTCCTCCGCCGCCGCCGAGGCGACGCCGTCCACCGGCGCATCCAAATCCTCGCGCGGCGGCGGAAGCGGAGGGCTGGCGCCGTCGAAATCGACGGTGTACGTCAGCAACATCGACTACAACCTGACCAACTCCGACCTCCACACGATCTTCTCCACCTTCGGCAAGCTCGCCAAGGTCACGGTGCTCAAGGACCGCGCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789488.1
MPRKRNQSDDEEDDTFFYRYSSAAAEATPSTGASKSSRGGGSGGLAPSKSTVYVSNIDYNLTNSDLHTIFSTFGKLAKVTVLKDRATRQSKGVAFVLFVRREDAARAAKEMDGKILNGRTLRASIAADNGRATEFIKKKVYKDKSRCYECGEEGHLSYECPRNFLGPRERPPPPKKGRRGGSGGGESRGRDFEGGEEEEEEEREDEGELEMENWASVVDGGGAAEERLLKVEDGKGGVRKERREKKKGYFSDESDDED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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