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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006061`

染色体: Chr01 坐标: 76048442-76052733 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006061`
名称	SmilChr01G006061
描述	uncharacterized SmilChr01G006061
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76048442 - 76052733 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006312`
GeneID	`131006312`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006312`
原始查询	`SmilChr01G006061`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824653]; symbol=AT3G54880; hit=AT3G54880; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824653]; symbol=AT3G54880; hit=AT3G54880; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G54880` (AT3G54880) zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824653] identity=65; qcov=0.721; evalue=1.99e-35; confidence=medium
Rice	`Os07g0479600` - identity=58; qcov=0.73; evalue=3.07e-31; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13259 (clamp_Gag1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006312

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789495.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057789489.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057789495.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789489.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789489.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76049115`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	99	A1,A14,A16,A20,A22,A3,A5,A8,B10,B109,B11,B113,B114,B118,B119,B121,B123,B125,B13,B130,B131,B135,B137,B14,B2,B22,B25,B27,B28,B30,B31,B34,B36,B38,B39,B46,B47,B52,B53,B54,B56,B63,B64,B65,B66,B7,B71,B79,B8,B83,B86,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B95,B96,B99,C10,C12,C18,C25,C26,C27,C29,C30,C31,C35,C36,C41,C42,C44,C45,C5,C50,C53,C55,C6,C64,C66,C71,C72,C73,C75,C76,C77,C78,C80,C82,C87,C9,D1,D10,D4,D5,D6,D9
`Chr1:76049169`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	22	B106,B115,B18,B20,B45,B56,B74,B87,B96,C15,C2,C21,C28,C34,C38,C56,C67,C74,C78,C83,C85,D8
`Chr1:76049303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:76049503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:76049509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789495.1

111 aa

111

clamp_Gag1-like

PF13259 clamp_Gag1-like 71-111 aa

XP_057789496.1

111 aa

111

clamp_Gag1-like

PF13259 clamp_Gag1-like 71-111 aa

XP_057789497.1

111 aa

111

clamp_Gag1-like

PF13259 clamp_Gag1-like 71-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789495.1`	Pfam	`PF13259`	clamp_Gag1-like	Domain	71	111	5e-17	63.2	Gag1-like, clamp domain
`XP_057789496.1`	Pfam	`PF13259`	clamp_Gag1-like	Domain	71	111	5e-17	63.2	Gag1-like, clamp domain
`XP_057789497.1`	Pfam	`PF13259`	clamp_Gag1-like	Domain	71	111	5e-17	63.2	Gag1-like, clamp domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

11 records

下载 cDNA FASTA

XR_009095452.1
TGGGGAATCTGAAAAGGGTGAGCCACCTAACAACGAGAACGACATTTGCATATTCTTGAGCCCACATTCTCTGCCTATATATATCCCCTCTTCCCATTGTAAGAGCTTTCTTTCTTTCTCTTTTCTCCTTCTCGCTTTGGAACACAGCCCACTAAAGATCTCTGTTAGAAAGAAAATCCTGGAGAATGTTACGAGTTATTCGACTTTGCTGACTATCAATACTTGGGTATATACGAGAGCAGATCATTATTTCAGATACA...

XR_009095453.1
TCTTTCTCTTTTCTCCTTCTCGCTTTGGAACACAGCCCACTAAAGGTACAAATTTTCTTTCTCTCTCTATCTTTTCTTTTATTTATTTTTATGCTTTTGGTTTTTGTGGTTTCTTGTTTTCTTTCTTAGTTGTTTATGTTTTTCTTTATTGCTCCCTCTCTTTATAAATATGCAAATTTGGGGTTATATTTGTCGAGAGAGTGGATCTTCCAGACTTTAGTCTTGACGGTGGGAAGAAAAGATTGTAATTTGAGGGAAAT...

CDS

9 records

下载 CDS FASTA

LOC131006312
ATGATGGAAATAAATGGTAAAGCTTCCCACAATAATGAGCAGAAGACTTTGGTTTCTGCACCTCCGGCCAATGTACCAAAAAGGACATCAGAGAATAATTCGAGCACTTCTATATTTGTCAATCATGCTGCCATTGCATGGGCTGAGAGCAGAAGAAAATGGATTGGAAATGCTCCTCAGAGGTCAGACAGAACAATGAAGGATCCGATTATAAGCTGGTCCACAACCTACGAGGATCTGCTCTTGACTCACGATCCATT...

Protein

9 records

下载 Protein FASTA

XP_057789489.1
MMEINGKASHNNEQKTLVSAPPANVPKRTSENNSSTSIFVNHAAIAWAESRRKWIGNAPQRSDRTMKDPIISWSTTYEDLLLTHDPFSEPIPLPIESNTNRLYRLGMMTFQQPQPSFLCYTIRLVSILHVC

XP_057789490.1
MMEINGKASHNNEQKTLVSAPPANVPKRTSENNSSTSIFVNHAAIAWAESRRKWIGNAPQRSDRTMKDPIISWSTTYEDLLLTHDPFSEPIPLPIESNTNRLYRLGMMTFQQPQPSFLCYTIRLVSILHVC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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