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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006065`

染色体: Chr01 坐标: 76067041-76075726 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006065`
名称	SmilChr01G006065
描述	protein SEEDLING PLASTID DEVELOPMENT 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76067041 - 76075726 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006314`
GeneID	`131006314`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006314`
原始查询	`SmilChr01G006065`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SEEDLING PLASTID DEVELOPMENT 1
产物	protein SEEDLING PLASTID DEVELOPMENT 1
Arabidopsis	`AT3G10420` (SPD1) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820206] identity=62.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0187400` - identity=61.3; qcov=0.943; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00004 (AAA); PF19568 (Spore_III_AA); PF25516 (PTPase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006314

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057789499.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057789499.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057789499.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789499.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789499.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76067784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B79,B87
`Chr1:76068276`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C18
`Chr1:76068276`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C18
`Chr1:76069145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B48,B53,C51,D9
`Chr1:76069603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:76069673`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C76
`Chr1:76069673`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C76
`Chr1:76070468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B118
`Chr1:76070632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789499.1

732 aa

366

732

Spore_III_AA

AAA

PTPase

PF19568 Spore_III_AA 192-347 aa PF00004 AAA 221-305 aa PF25516 PTPase 517-597 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789499.1`	Pfam	`PF19568`	Spore_III_AA	Family	192	347	2.8e-14	53.7	Sporulation stage III, protein AA
`XP_057789499.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	221	305	7.4e-05	23.9	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057789499.1`	Pfam	`PF25516`	PTPase	Domain	517	597	9.7e-28	96.6	Phosphotyrosine protein phosphatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933516.1
GGAAAATTCAGACATACAGACCAAATAGGTAACGTAACCGAAACGTGTGGTCTGAAGCAGCCACACCACGTGGTGCAATTTCATGTGGACAGTTCGTTGCTCTCTTCAATGGACCCCTCTCTCTCTCTCACCTTCCAATCCCAATGGAGATCCCAACGAATCTTCCTCTCTCTCTTCCCAATTCATTTCTCAACTTCCAATCAGAGTTCGCATTCCACAAGCAAAAAAAACTCGATTAATTTTTATCTATATATGTGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006314
ATGAGGGCTCTGAATTCCCATTTCGTGCTGATCGATCTTCACACCTCATGGTGCTCAGCTCAGCAAATCCCCAATTCAACCTTCGCGTACCTGCACAAGTCCGCGGCTCCTTCCTTCTCTGCGGCCGTTCGTCGAACACGTGGTGGGCGGGGGAGGATCTCGTCGTCCCGAGCTCCATCGCCGGAGGCGAGGTCGCCGGAGATTCGAAGGCCGACGGCGTTGGGAAATGGCTTCTCGTCGGCCTCCTCCAACACGGCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789499.1
MRALNSHFVLIDLHTSWCSAQQIPNSTFAYLHKSAAPSFSAAVRRTRGGRGRISSSRAPSPEARSPEIRRPTALGNGFSSASSNTASVSSSGRRGDEVVSDMDLFLEIVPLRMRHELFRHEKIGELIEVVMDLGRKPLARFPSGDSVISEQPVMPEDLLHAISKVGEFSDDNRSGINHSLHRISAIRNRKMQIIGLTCRVGRAVSGSADIIRDLVESGGSILVIGPPGVGKTTLIRETARILADDQKKRVVIVDTSNEIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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