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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006066`

染色体: Chr01 坐标: 76071536-76075726 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006066`
名称	SmilChr01G006066
描述	glycine-rich RNA-binding protein RZ1C-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76071536 - 76075726 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006317`
GeneID	`131006317`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006317`
原始查询	`SmilChr01G006066`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycine-rich RNA-binding protein RZ1C-like
产物	glycine-rich RNA-binding protein RZ1C-like
Arabidopsis	`AT5G04280` (AtRZ-1c) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830307] identity=52.4; qcov=1.02; evalue=8.3e-73; confidence=high
Rice	`Os03g0681900` (OsRZ3) - identity=44.4; qcov=1.08; evalue=2.18e-54; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF00098 (zf-CCHC); PF16367 (RRM_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006317

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789501.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	1.00000	`XP_057789501.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057789501.1`
4	Chromatin	染色质	0.20000	`XP_057789501.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789501.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76074781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:76075042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr1:76075342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr1:76075546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789501.1

287 aa

144

287

RRM_7

RRM_1

zf-CCHC

PF16367 RRM_7 9-69 aa PF00076 RRM_1 10-79 aa PF00098 zf-CCHC 120-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789501.1`	Pfam	`PF16367`	RRM_7	Domain	9	69	4.8e-07	30.4	RNA recognition motif
`XP_057789501.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	10	79	8.5e-22	77.5	RNA recognition motif
`XP_057789501.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	120	135	2e-08	34.6	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933518.1
GCCAGAGATTTGGTCGAGATGGGGGACAAGGACCAAGATTACCGTATATTCGTCGGAGGTTTATCGTGGGATGTTACTGAGCGGCAGCTCGAAAGTGCTTTTAGTCGTTTTGGAAAAATTATGAGCTGCCAGGTTGTGCTTGAAAGAGATACGGGCCGTCCTCGGGGATTTGGCTTCTTGACCTTTGCGGACCGCAGGGCAATGGAGGATGCAATTCGGGATATGCATGGTCGAGAACTTGGAGACCGAGTAATCTCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006317
ATGGGGGACAAGGACCAAGATTACCGTATATTCGTCGGAGGTTTATCGTGGGATGTTACTGAGCGGCAGCTCGAAAGTGCTTTTAGTCGTTTTGGAAAAATTATGAGCTGCCAGGTTGTGCTTGAAAGAGATACGGGCCGTCCTCGGGGATTTGGCTTCTTGACCTTTGCGGACCGCAGGGCAATGGAGGATGCAATTCGGGATATGCATGGTCGAGAACTTGGAGACCGAGTAATCTCTGTTAACAAGGCCCAGCCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789501.1
MGDKDQDYRIFVGGLSWDVTERQLESAFSRFGKIMSCQVVLERDTGRPRGFGFLTFADRRAMEDAIRDMHGRELGDRVISVNKAQPKGGEDQGPRYGSYSAGGRGGYGGRDRPTAGQDDCFKCGRPGHWARDCPSAGGGGGGRGGGRPFSPPRSRYPGAATRGDRYADIRDRYVDDKYDRGRYDDRDRYEIKDDRYGSRDRYATDRYPPPVDRFPVDRFPPTADRYPVNGYGKDRAYDREAGPRGSGDRYGGGVAPARYD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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