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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006085`

染色体: Chr01 坐标: 76338295-76339200 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006085`
名称	SmilChr01G006085
描述	receptor-like protein 20
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76338295 - 76339200 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013943`
GeneID	`131013943`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013943`
原始查询	`SmilChr01G006085`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 20
产物	receptor-like protein 20
Arabidopsis	`AT2G33060` (RLP27) receptor like protein 27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817868] identity=44.2; qcov=0.924; evalue=3.02e-61; confidence=medium
Rice	`Os12g0221700` - identity=42.9; qcov=0.884; evalue=7.94e-59; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13516 (LRR_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013943

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797863.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797863.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797863.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797863.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797863.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76338354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr1:76338375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr1:76338388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B109,B121
`Chr1:76338427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:76338576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B69,C5,C63
`Chr1:76338600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B81,C7
`Chr1:76338609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:76338666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C79
`Chr1:76338762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:76338763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:76338766`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B107,B109,B134,B69,C12,C30,C40,C85
`Chr1:76338770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B59,B71,C12,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797863.1

301 aa

150

301

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF00560 LRR_1 99-119 aa PF13516 LRR_6 120-132 aa PF00560 LRR_1 121-142 aa PF00560 LRR_1 146-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797863.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	99	119	9.2e-20	67.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057797863.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	120	132	1.7e-07	31.5	Leucine Rich repeat
`XP_057797863.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	121	142	9.2e-20	67.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057797863.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	146	167	9.2e-20	67.2	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941880.1
ATGGAAGCTCTTCCTAAGCTTCGAGTACTCATATTGAAGTCCAACAAGTTTGATGGTAACATGTCGCTGCCTTCACGAAGCAACCTTCCATTTCCTAAGTTGCAAGTTTTAGATATATCAGAGAATGAATTTGTGGGGTCTTTACCTCAAAAATATTTCAAGAATTTCAGAGCAATGATGGATATGAAGGAAAATCAAACAGATGGTGATTATGACTATTTTTCAAATTACGTGGAGATGACAATCACCTTGAAAGGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013943
ATGGAAGCTCTTCCTAAGCTTCGAGTACTCATATTGAAGTCCAACAAGTTTGATGGTAACATGTCGCTGCCTTCACGAAGCAACCTTCCATTTCCTAAGTTGCAAGTTTTAGATATATCAGAGAATGAATTTGTGGGGTCTTTACCTCAAAAATATTTCAAGAATTTCAGAGCAATGATGGATATGAAGGAAAATCAAACAGATGGTGATTATGACTATTTTTCAAATTACGTGGAGATGACAATCACCTTGAAAGGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797863.1
MEALPKLRVLILKSNKFDGNMSLPSRSNLPFPKLQVLDISENEFVGSLPQKYFKNFRAMMDMKENQTDGDYDYFSNYVEMTITLKGLDQLLKRLLEDFTTIDLSSNNFSGSIPDSIGNLNSLRYLNLSHNNLMGHIPASLGNISVLESLDLSSNKLDGGIPSELTRLTFLAKLNLSMNDLVGQIPQSTQFSTFENDSYVGNLRLCGFPLTRKCNEENGQRMQPEEQDDEDDEYGFIDGFGWRSVVMGYGGGIIVGIGIGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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