当前解析结果
SmilChr01G006099| 统一新 Gene ID | SmilChr01G006099 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G006099 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G006099 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 76484154 - 76486020 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006338 |
|---|---|
| GeneID | 131006338 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006338 |
| 原始查询 | SmilChr01G006099 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | OsWD40-5; symbol=OsWD40-5; hit=Os01g0183100; species=rice; confidence=low |
| 产物 | OsWD40-5; symbol=OsWD40-5; hit=Os01g0183100; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G10530 (AT3G10530)Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820218] identity=54.4; qcov=0.447; evalue=4.59e-07; confidence=low |
| Rice | Os01g0183100 (OsWD40-5)- identity=53.5; qcov=0.563; evalue=9.97e-09; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006338 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057789532.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057789532.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057789532.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057789532.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789532.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:76484905 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 8 | A1,B102,B35,B69,B74,B98,C59,C74 |
Chr1:76484935 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C48,D11 |
Chr1:76485213 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B136,B28,C35,C46 |
Chr1:76485274 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B128 |
Chr1:76485342 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B20 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。