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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G006110`

染色体: Chr01 坐标: 76639757-76649941 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G006110`
名称	SmilChr01G006110
描述	receptor-like protein 9DC3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	76639757 - 76649941 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006329`
GeneID	`131006329`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006329`
原始查询	`SmilChr01G006110`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 9DC3
产物	receptor-like protein 9DC3
Arabidopsis	`AT2G25440` (RLP20) receptor like protein 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817082] identity=41.3; qcov=0.926; evalue=5.99e-74; confidence=medium
Rice	`Os01g0161000` - identity=40.5; qcov=0.875; evalue=1.33e-74; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13516 (LRR_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006329

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789523.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789523.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789523.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789523.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789523.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:76648822`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B115,B20,B22,B33,B57,C44,C6,C79
`Chr1:76648966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:76649121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,C85
`Chr1:76649142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr1:76649334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B55,B9,C2,C6
`Chr1:76649341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C26
`Chr1:76649341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:76649581`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B75
`Chr1:76649581`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789523.1

353 aa

176

353

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF00560 LRR_1 5-27 aa PF00560 LRR_1 149-169 aa PF13516 LRR_6 171-182 aa PF00560 LRR_1 171-192 aa PF00560 LRR_1 196-217 aa PF00560 LRR_1 220-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789523.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	5	27	4.3e-24	80.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789523.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	149	169	4.3e-24	80.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789523.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	171	182	1.5e-09	37.9	Leucine Rich repeat
`XP_057789523.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	171	192	4.3e-24	80.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789523.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	196	217	4.3e-24	80.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057789523.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	220	237	4.3e-24	80.1	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933540.1
CCACCATTGGGAATCTATCAAATCTACATGAATTAGATCTCTCTTCCAACAAATTAAATGGATCAATACCATCCACTATTGGGAATTTACCAGATTTACTTTATTTACAACTCTCTTCCAATAAAGTAAATGGTGAGCTACCGTTCTCTCTCTGCAACTTGACATCCTTGGGATATCTTCTTCTCTCAAATAATAGTTTCGAAGGGACACTTCCACGATGCTTTCAAAACTTGAGTCAATCTCTACGTATCTTTCATTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006329
ATGGAAGGGTGTAGTATTGAGTCCATCAATTTGAATGGTAATAAATTGCAAGGAAATTTGCCTAAATCATTAATCAATTGCGTACGCCTGAAGGACCTCGACGTCGGAAATAATAGATTACAAGACAAATTTCCGTTTTGGATGGAAGCTCTTCCTATGCTTCGAGTGTTAGTCTTGAAATCTAACAAGTTTGATGGTAACTTGTCTATGCCTTCACGTAGCAACTTTCCATTTCCTAAGTTGCAAGTATTAGATATATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789523.1
MEGCSIESINLNGNKLQGNLPKSLINCVRLKDLDVGNNRLQDKFPFWMEALPMLRVLVLKSNKFDGNLSMPSRSNFPFPKLQVLDISRNAFVGSLPQRYFKNFKAMMDDKANQRERYNDGDLNFLYYVEMTITLKGQDQLLKRLLEAFTILDLSSNRFSGSIPDCIGNLYSLRYLNLSHNNLMGHIPASLGNISVLESLDLSSNKLDGGIPRELTRLTFLEKLNLSMNNLVGQIPQSNQFSTFDNDSYMGNLRLCGIPLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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